More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1603 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1603  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 124 aa  249  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  98.39 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16911  30S ribosomal protein S12  99.19 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17141  30S ribosomal protein S12  97.58 
 
 		 124 aa  247  5e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  95.93 
 
 		 123 aa  238  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0323  30S ribosomal protein S12  91.94 
 
 		 124 aa  231  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436822  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  91.13 
 
 		 125 aa  230  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2019  30S ribosomal protein S12  91.94 
 
 		 124 aa  229  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  89.43 
 
 		 124 aa  229  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  89.43 
 
 		 136 aa  227  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  90.32 
 
 		 124 aa  226  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  89.52 
 
 		 124 aa  225  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 124 aa  223  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  85.48 
 
 		 127 aa  221  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  86.29 
 
 		 127 aa  221  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 125 aa  220  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 125 aa  220  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  210  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  203  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  203  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 127 aa  202  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 127 aa  201  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  200  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  200  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  77.87 
 
 		 123 aa  200  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  200  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  200  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 123 aa  200  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 123 aa  200  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 123 aa  200  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  200  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  200  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0355  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1770  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 128 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 125 aa  198  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000378884  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  198  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 126 aa  197  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 126 aa  197  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06190  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  197  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  197  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  196  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1903  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120307  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2157  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.949049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2118  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2435  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  196  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 127 aa  196  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1800  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278795  normal  0.143842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 126 aa  196  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  196  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  196  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 137 aa  196  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  196  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  196  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  196  7.999999999999999e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>