197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1537 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 413 aa  815    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  82.57 
 
 		 413 aa  677    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  82.32 
 
 		 413 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  66.1 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  38.75 
 
 		 440 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  36.43 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.84 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  33.5 
 
 		 441 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  29.66 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.6 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  26.53 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  28.12 
 
 		 489 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.9 
 
 		 492 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  27.08 
 
 		 566 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  27.18 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  28.35 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.91 
 
 		 472 aa  152  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  26.51 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  26.28 
 
 		 479 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.49 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  31.4 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  27.92 
 
 		 448 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  27.6 
 
 		 448 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  27.34 
 
 		 481 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  22.93 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.16 
 
 		 513 aa  94.4  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.41 
 
 		 517 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.41 
 
 		 517 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  24.42 
 
 		 520 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  29.68 
 
 		 496 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.65 
 
 		 517 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  22.34 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.3 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  23.18 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  21.02 
 
 		 531 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  21.62 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  27.64 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  20.7 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  22.7 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  27.42 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  23.62 
 
 		 545 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  21.03 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  22.79 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_2271  predicted protein  24.34 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  28.09 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  30 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.37 
 
 		 548 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.57 
 
 		 637 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  18.59 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  30.5 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  26.11 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  28.57 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  24.06 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  25.5 
 
 		 441 aa  53.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  31.18 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  29.56 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  25.38 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  23.78 
 
 		 650 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  30.4 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  29.82 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  30.89 
 
 		 494 aa  50.8  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0490  small GTP-binding protein  29.01 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  35.71 
 
 		 460 aa  50.4  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  36.67 
 
 		 456 aa  50.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  30.77 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  33.05 
 
 		 439 aa  49.7  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  25.97 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  30.77 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  25.97 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  32.48 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  33.09 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  36.26 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1338  GTP-binding protein EngA  28.65 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.53279  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  30.25 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  33.09 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1348  GTP-binding protein EngA  28.65 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  24.55 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  24.24 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  30.28 
 
 		 583 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  23.95 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0680  GTP-binding protein Era  33.57 
 
 		 290 aa  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  20.5 
 
 		 459 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  25.47 
 
 		 473 aa  47.8  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  24.69 
 
 		 473 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  30.25 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  25.85 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  30.82 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  22.47 
 
 		 483 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  30.82 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  22.47 
 
 		 483 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  31.93 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  31.93 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.73 
 
 		 287 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  24.31 
 
 		 303 aa  47  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  31.39 
 
 		 438 aa  47  0.0006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  28.51 
 
 		 455 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  22.47 
 
 		 483 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  29.8 
 
 		 589 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  32.81 
 
 		 458 aa  47  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>