73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1515 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  785    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  61.21 
 
 		 390 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  58.56 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  33.58 
 
 		 513 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  33.82 
 
 		 510 aa  160  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  29.13 
 
 		 528 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  32.32 
 
 		 543 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  31.42 
 
 		 500 aa  152  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  30.49 
 
 		 518 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  29.41 
 
 		 555 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  28.98 
 
 		 561 aa  136  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  28.91 
 
 		 531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  27.36 
 
 		 415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  28.06 
 
 		 514 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  25.4 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  28.22 
 
 		 515 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  29.84 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  26.32 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  26.98 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  24.89 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  28.37 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  27.81 
 
 		 515 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  26.77 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  27.59 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  27.55 
 
 		 328 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  29.08 
 
 		 335 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  24.24 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  29.05 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  32.34 
 
 		 475 aa  93.6  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  25.12 
 
 		 524 aa  88.6  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  28.1 
 
 		 336 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  28.83 
 
 		 333 aa  86.3  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  28.42 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  28.22 
 
 		 543 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  26.96 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  28.12 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  27.06 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  27.18 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  27.27 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  26.48 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  29 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  24.93 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  25.26 
 
 		 548 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  27.32 
 
 		 550 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  26.06 
 
 		 578 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  25.58 
 
 		 531 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  23.75 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  22.56 
 
 		 544 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  24.57 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  25.92 
 
 		 551 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  23.89 
 
 		 571 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  23.1 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  25.63 
 
 		 574 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  23.8 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  23.91 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  28.11 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  24.6 
 
 		 508 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  25.45 
 
 		 561 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  29.52 
 
 		 624 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  25.21 
 
 		 586 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  25.21 
 
 		 586 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  22.54 
 
 		 581 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  22.54 
 
 		 581 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  23.6 
 
 		 591 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  24.4 
 
 		 529 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  23.12 
 
 		 542 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  36.14 
 
 		 491 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 		 641 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  34.78 
 
 		 666 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  36.76 
 
 		 658 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  23.58 
 
 		 563 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  34.78 
 
 		 666 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  31.11 
 
 		 604 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>