69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1512 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  864    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  33.89 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  32.48 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  31.16 
 
 		 426 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  29.95 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  31.98 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  31.44 
 
 		 450 aa  126  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  31.63 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  33.72 
 
 		 333 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  32.35 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  34 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  28.54 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  32.6 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  31.12 
 
 		 399 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  31.45 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  27.68 
 
 		 355 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  30.56 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  26.67 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  26.97 
 
 		 513 aa  92.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  24.51 
 
 		 500 aa  89.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  26.22 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  31.61 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  25 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  30.84 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  31.28 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  25.91 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  32.88 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  27.2 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  26.13 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  34.19 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  26.24 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  26.41 
 
 		 514 aa  73.2  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  23.68 
 
 		 543 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  30.67 
 
 		 475 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  23.99 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  24.45 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  23.26 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  29.23 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  24.19 
 
 		 515 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  24.87 
 
 		 531 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  26 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  25.99 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  22.55 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  24.07 
 
 		 574 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  28.36 
 
 		 551 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  26.89 
 
 		 542 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  27.81 
 
 		 548 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  32.85 
 
 		 518 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  30.6 
 
 		 544 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  24.84 
 
 		 491 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  27.32 
 
 		 533 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  28.86 
 
 		 531 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  27.6 
 
 		 624 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  22.98 
 
 		 529 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  26.01 
 
 		 639 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  26.32 
 
 		 543 aa  50.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  26.34 
 
 		 581 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  26.34 
 
 		 581 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  25.42 
 
 		 578 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  25.42 
 
 		 550 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  25.65 
 
 		 568 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  24.57 
 
 		 591 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  23.71 
 
 		 604 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  27.56 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  26.81 
 
 		 539 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  22.17 
 
 		 571 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  24.71 
 
 		 586 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  24.71 
 
 		 586 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  32.04 
 
 		 641 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>