17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1414 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1414  high light inducible protein-like  100 
 
 
81 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.680759  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15161  high light inducible protein  91.36 
 
 
81 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.163919  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15031  high light inducible protein  91.36 
 
 
81 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14781  high light inducible protein  80.52 
 
 
92 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17411  high light inducible protein  60.56 
 
 
97 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0886  high light inducible protein  52.08 
 
 
97 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.139188  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13681  high light inducible protein  54.22 
 
 
86 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279574  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  45.45 
 
 
71 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  48 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  46.34 
 
 
77 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  51.52 
 
 
66 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0824  high light inducible protein  38.3 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  65.38 
 
 
56 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1831  high light inducible protein  38.3 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4587  high light inducible protein  40.62 
 
 
67 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.47687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  61.54 
 
 
56 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  67.86 
 
 
54 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>