76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1271 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  93.47 
 
 		 352 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  92.61 
 
 		 352 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  93.47 
 
 		 352 aa  658    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  100 
 
 		 352 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  76 
 
 		 352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  74.36 
 
 		 352 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  74.07 
 
 		 352 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  65.91 
 
 		 352 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  64.49 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  64.49 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  63.64 
 
 		 352 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  63.82 
 
 		 349 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  64.1 
 
 		 349 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  63.9 
 
 		 351 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  65.14 
 
 		 368 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  60.17 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  65 
 
 		 349 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  65 
 
 		 349 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  57.38 
 
 		 362 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  57.38 
 
 		 362 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11601  hypothetical protein  63.02 
 
 		 349 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0985613 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  59.21 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  59.21 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  61.32 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  57.88 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  57.73 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0991489 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  56.2 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  55.56 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  58.05 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  58.94 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  58.94 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  55.28 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  56.5 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  49.15 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  50 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  49.86 
 
 		 342 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  47.83 
 
 		 344 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  44.18 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  38.4 
 
 		 522 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  38.8 
 
 		 368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  37.66 
 
 		 461 aa  175  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  37.84 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  37.84 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  37.84 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  37.84 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.81 
 
 		 460 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.81 
 
 		 460 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  38.39 
 
 		 459 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  38.06 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  38.06 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  38.51 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  38.06 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  36.83 
 
 		 459 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  39.29 
 
 		 473 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  37 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  37.34 
 
 		 462 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  37.34 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.47 
 
 		 460 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  30.23 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.47 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.14 
 
 		 507 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  28.48 
 
 		 507 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.8 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.8 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  25.96 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  25.83 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  25.08 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  25 
 
 		 519 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  24.09 
 
 		 510 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  24.83 
 
 		 509 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000124352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  24.42 
 
 		 508 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  28.35 
 
 		 508 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  24.42 
 
 		 508 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  37.31 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  29.13 
 
 		 508 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  23.53 
 
 		 508 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>