114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1262 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1262  putative hydroxylase  100 
 
 
221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13531  putative hydroxylase  80.09 
 
 
221 aa  363  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13621  putative hydroxylase  75.57 
 
 
222 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.436442  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13321  putative hydroxylase  84.04 
 
 
189 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0775  putative hydroxylase  59.28 
 
 
221 aa  277  8e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16191  putative hydroxylase  58.82 
 
 
221 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12561  putative hydroxylase  58.37 
 
 
221 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131814 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20491  putative hydroxylase  53.85 
 
 
221 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2001  putative hydroxylase  51.14 
 
 
222 aa  240  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.563142  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1577  putative hydroxylase  48.2 
 
 
222 aa  234  9e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.572766  normal  0.0227046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2258  putative hydroxylase  43.05 
 
 
222 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0352243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2196  putative hydroxylase  42.6 
 
 
222 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0015  putative hydroxylase  42.71 
 
 
223 aa  187  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal  0.457656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1929  putative hydroxylase  39.73 
 
 
220 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1675  putative hydroxylase  41.49 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.899153  normal  0.0319364 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3426  putative hydroxylase  38.32 
 
 
223 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4479  putative hydroxylase  33.8 
 
 
227 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0037  2OG-Fe(II) oxygenase  38.86 
 
 
219 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3078  putative hydroxylase  35.94 
 
 
228 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5004  putative hydroxylase  33.33 
 
 
227 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2559  putative hydroxylase  36.82 
 
 
227 aa  141  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3244  putative hydroxylase  36.02 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054374  hitchhiker  0.00000245191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0717  putative hydroxylase  36.19 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266806  hitchhiker  0.000189122 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3575  putative hydroxylase  33.8 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.574336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0698  putative hydroxylase  36.02 
 
 
224 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00417487  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3084  putative hydroxylase  33.33 
 
 
227 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.418159  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3913  putative hydroxylase  35.71 
 
 
224 aa  138  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0219  putative hydroxylase  33.95 
 
 
227 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7102  putative hydroxylase  33.02 
 
 
227 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1523  2OG-Fe(II) oxygenase  37.77 
 
 
259 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2273  putative hydroxylase  38.71 
 
 
227 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1130  putative hydroxylase  34.52 
 
 
227 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1313  putative hydroxylase  35.68 
 
 
209 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325019  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3048  putative hydroxylase  35.61 
 
 
227 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1709  putative hydroxylase  37 
 
 
230 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.822877  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5374  putative hydroxylase  35.48 
 
 
227 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983229  normal  0.422627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0528  putative hydroxylase  36.53 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1077  putative hydroxylase  38.07 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1638  putative hydroxylase  36.5 
 
 
230 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2089  putative hydroxylase  34.67 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1570  2OG-Fe(II) oxygenase  36.1 
 
 
231 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1172  2OG-Fe(II) oxygenase  35.94 
 
 
226 aa  131  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7101  putative hydroxylase  32.09 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3334  putative hydroxylase  31.36 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0690816  normal  0.437526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3634  putative hydroxylase  33.81 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0721  putative hydroxylase  33.81 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000319663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0750  putative hydroxylase  33.81 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.904412  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0045  putative hydroxylase  35.86 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3725  hypothetical protein  34.53 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.780792 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1949  2OG-Fe(II) oxygenase  35.03 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0741  putative hydroxylase  33.81 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0366446  hitchhiker  0.0000066194 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3916  putative hydroxylase  32.87 
 
 
228 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.721944  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0512  putative hydroxylase  35.62 
 
 
234 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.647783  normal  0.011367 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3803  putative hydroxylase  32.87 
 
 
228 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2877  putative hydroxylase  31.39 
 
 
228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3968  putative hydroxylase  34.17 
 
 
229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2812  putative hydroxylase  35.71 
 
 
226 aa  128  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.192542  decreased coverage  0.000000224129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3541  putative hydroxylase  36 
 
 
229 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2199  2OG-Fe(II) oxygenase  31.84 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.568044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00771  putative hydroxylase  32.66 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2838  2OG-Fe(II) oxygenase  32.66 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0612  2OG-Fe(II) oxygenase  33.03 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240573  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00788  hypothetical protein  32.66 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0859  putative hydroxylase  32.66 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2839  putative hydroxylase  32.66 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.113073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03560  putative hydroxylase  32.88 
 
 
226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2548  putative hydroxylase  33.17 
 
 
225 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2317  putative hydroxylase  33.83 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000110026  hitchhiker  0.000149055 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4677  putative hydroxylase  36.17 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000773199  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0872  putative hydroxylase  32.16 
 
 
225 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0828  putative hydroxylase  32.66 
 
 
225 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0577  2OG-Fe(II) oxygenase  33.67 
 
 
225 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0176076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0106  2OG-Fe(II) oxygenase  32.26 
 
 
227 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1514  putative hydroxylase  32.66 
 
 
229 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0099  2OG-Fe(II) oxygenase  31.96 
 
 
227 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3637  putative hydroxylase  32.11 
 
 
228 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4046  putative hydroxylase  34.01 
 
 
227 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4316  putative hydroxylase  33.5 
 
 
226 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0120702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12340  putative hydroxylase  35.2 
 
 
226 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1809  2OG-Fe(II) oxygenase  34.55 
 
 
228 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3793  putative hydroxylase  32.26 
 
 
227 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0905  putative hydroxylase  33 
 
 
226 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0838  putative hydroxylase  33.49 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0892  putative hydroxylase  31.48 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.137748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0862  putative hydroxylase  33 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12420  putative hydroxylase  31.03 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.455137  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3557  putative hydroxylase  33.5 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4810  putative hydroxylase  33.5 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63397  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5473  putative hydroxylase  33.5 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632728 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0953  putative hydroxylase  31.68 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0236  2OG-Fe(II) oxygenase  34.69 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.740629  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5129  putative hydroxylase  32.5 
 
 
242 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482297  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4714  putative hydroxylase  32.99 
 
 
227 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.730869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0701  putative hydroxylase  34.69 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0990  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
225 aa  118  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.20118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0803  putative hydroxylase  35.2 
 
 
222 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4192  putative hydroxylase  32.99 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540469  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58580  putative hydroxylase  31.48 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00121484  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0377  putative hydroxylase  31.37 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925919  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4660  putative hydroxylase  32.99 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>