68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1219 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  95.39 
 
 		 434 aa  796    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  100 
 
 		 434 aa  853    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  83.37 
 
 		 436 aa  729    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  95.16 
 
 		 434 aa  795    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  71.79 
 
 		 435 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  72.13 
 
 		 437 aa  614  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  72.37 
 
 		 437 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  66.43 
 
 		 431 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  67.37 
 
 		 460 aa  535  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  39.11 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  38.52 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  39.39 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  39.39 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  38 
 
 		 421 aa  254  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  39.39 
 
 		 424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  38.81 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  39.15 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  39.11 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  39.11 
 
 		 428 aa  253  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  39.09 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  38.42 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  37.86 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  39.34 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  35.28 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  36.3 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  38.46 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  34.38 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  34.38 
 
 		 428 aa  227  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  34.7 
 
 		 422 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  37.25 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  36.13 
 
 		 419 aa  222  9e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  36.26 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  34.65 
 
 		 423 aa  221  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  34.92 
 
 		 421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  36.68 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  33.33 
 
 		 421 aa  202  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  32.32 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  31.5 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  35.07 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  22.85 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  23.6 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  20.51 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  22.35 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  27.32 
 
 		 406 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  25.07 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  22.86 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  22.27 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  19.5 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  22 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  28.44 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  23.13 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  20.7 
 
 		 508 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  24.5 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  24.34 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  25.62 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  25.16 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  25.36 
 
 		 415 aa  46.6  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  24.02 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  23.77 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  22.1 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  22.44 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  23.63 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  28.93 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  28.93 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  28.93 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  64.71 
 
 		 52 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  33.7 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>