More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1202 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
632 aa  1273  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 
909 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  36.59 
 
 
816 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
750 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
654 aa  314  3e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
1085 aa  308  2e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 
1094 aa  290  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
732 aa  287  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
4489 aa  285  2e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
647 aa  285  2e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 
3560 aa  284  4e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
3035 aa  280  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
739 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
618 aa  275  1e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
611 aa  273  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
667 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
761 aa  257  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  38.68 
 
 
395 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
700 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
706 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 
660 aa  250  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
808 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
616 aa  249  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  26.29 
 
 
680 aa  245  1e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
708 aa  235  2e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  26.77 
 
 
560 aa  234  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
740 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  32.5 
 
 
657 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
968 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  31.42 
 
 
566 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 
750 aa  227  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  31.01 
 
 
492 aa  225  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  30.83 
 
 
657 aa  223  1e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  30.25 
 
 
459 aa  221  2e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  23.87 
 
 
585 aa  221  4e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  29.95 
 
 
624 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
1714 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
1106 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
569 aa  218  3e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  30.22 
 
 
588 aa  215  2e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.39 
 
 
1106 aa  213  6e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
828 aa  213  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 
672 aa  212  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.74 
 
 
589 aa  211  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 
627 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  21.69 
 
 
568 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  28.75 
 
 
637 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 
789 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
828 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 
789 aa  203  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
828 aa  203  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  26.65 
 
 
632 aa  202  2e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 
574 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
647 aa  201  4e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  29.81 
 
 
582 aa  201  4e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 
754 aa  201  4e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.47 
 
 
589 aa  200  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  38.23 
 
 
295 aa  200  8e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  4.90816e-07  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 
754 aa  200  8e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 
598 aa  197  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  28.25 
 
 
452 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
619 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.94 
 
 
570 aa  194  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
633 aa  193  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  20.32 
 
 
732 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  26.46 
 
 
633 aa  191  3e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  20.67 
 
 
717 aa  191  3e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 
833 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  26.74 
 
 
630 aa  190  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 
626 aa  190  6e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  20.12 
 
 
717 aa  190  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 
833 aa  190  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 
595 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 
529 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  22.16 
 
 
937 aa  186  1e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  27.27 
 
 
590 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
590 aa  184  5e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  20.31 
 
 
718 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  22.32 
 
 
699 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
633 aa  179  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 
713 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  23.68 
 
 
797 aa  177  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  22.5 
 
 
596 aa  176  1e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 
824 aa  175  2e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  21.82 
 
 
708 aa  174  6e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  23.83 
 
 
715 aa  174  6e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
734 aa  173  8e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.28 
 
 
667 aa  173  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  29.74 
 
 
1144 aa  173  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.39 
 
 
739 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  24.95 
 
 
745 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 
1143 aa  168  3e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  21.94 
 
 
790 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  26.18 
 
 
594 aa  167  6e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  23.69 
 
 
821 aa  167  7e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  23.69 
 
 
776 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  23.69 
 
 
776 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
727 aa  167  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  23.69 
 
 
776 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 
776 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>