More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0922 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
304 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  98.68 
 
 
304 aa  614  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  98.02 
 
 
304 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  90.1 
 
 
304 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  78.55 
 
 
305 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  77.89 
 
 
304 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  76.57 
 
 
306 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  77.56 
 
 
304 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  76.24 
 
 
304 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  76.57 
 
 
304 aa  495  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  67.66 
 
 
304 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  65.68 
 
 
304 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  65.68 
 
 
304 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  65.02 
 
 
304 aa  414  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  63.37 
 
 
304 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  43.81 
 
 
302 aa  246  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 
305 aa  243  3e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  42.52 
 
 
322 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  42.33 
 
 
306 aa  235  8e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  42.33 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
307 aa  232  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  42.33 
 
 
306 aa  231  9e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  37.7 
 
 
303 aa  229  3e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  38.96 
 
 
310 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  37.95 
 
 
322 aa  225  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  38.61 
 
 
303 aa  225  8e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  38.74 
 
 
305 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 
311 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 
307 aa  205  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  38.94 
 
 
307 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  39.67 
 
 
307 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 
312 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  38.94 
 
 
307 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  38.36 
 
 
307 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  38.94 
 
 
307 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  38.28 
 
 
307 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
311 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  37.94 
 
 
310 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  37.95 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  37.95 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  37.95 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  36.39 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 
317 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 
307 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 
307 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 
307 aa  195  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  40.59 
 
 
303 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 
306 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
309 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 
307 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  34.45 
 
 
306 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 
307 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  34.32 
 
 
312 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  38.94 
 
 
303 aa  192  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
307 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
313 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  37.17 
 
 
319 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  34.1 
 
 
308 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 
311 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  33.55 
 
 
308 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  39.6 
 
 
303 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  33.55 
 
 
308 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  40.26 
 
 
303 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  33.55 
 
 
308 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  35.88 
 
 
307 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  40.26 
 
 
303 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  33.99 
 
 
312 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  35.88 
 
 
308 aa  190  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  34.55 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  35.23 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 
303 aa  189  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 
312 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 
309 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  33.11 
 
 
309 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  34.53 
 
 
308 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  35.45 
 
 
306 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 
309 aa  188  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 
309 aa  188  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 
309 aa  188  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 
309 aa  188  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 
309 aa  188  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  34.97 
 
 
312 aa  188  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 
307 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 
309 aa  188  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 
309 aa  188  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 
309 aa  188  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  35.41 
 
 
312 aa  188  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 
308 aa  188  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
307 aa  188  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 
308 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>