More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0870 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  95.07 
 
 		 487 aa  917    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 489 aa  964    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  96.73 
 
 		 489 aa  936    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  80.12 
 
 		 486 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  56.97 
 
 		 489 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  55.78 
 
 		 495 aa  549  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  57.68 
 
 		 496 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  56.67 
 
 		 496 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  54.23 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  54.58 
 
 		 493 aa  521  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  46.09 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  46.93 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  46.25 
 
 		 470 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  46.11 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  45.31 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  45.31 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  46.09 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  46.17 
 
 		 464 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  33.99 
 
 		 515 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.27 
 
 		 761 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  33.41 
 
 		 533 aa  236  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  33.89 
 
 		 534 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  32.9 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  33.41 
 
 		 533 aa  229  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  32.14 
 
 		 487 aa  229  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  32.67 
 
 		 474 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  33.41 
 
 		 532 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  36.32 
 
 		 533 aa  224  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  33.41 
 
 		 533 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  33.8 
 
 		 530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  33.71 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  42.36 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  34.36 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  34.88 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  34.46 
 
 		 457 aa  217  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  32.61 
 
 		 538 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  35.82 
 
 		 524 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  32.94 
 
 		 531 aa  216  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  34.36 
 
 		 533 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.88 
 
 		 856 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  35.1 
 
 		 534 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  33.41 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  33.1 
 
 		 532 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  42.12 
 
 		 406 aa  213  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  32.64 
 
 		 532 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  33.62 
 
 		 594 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  37.85 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  31.32 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 748 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  32.44 
 
 		 531 aa  211  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.46 
 
 		 756 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  43.59 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  39.93 
 
 		 461 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  31.99 
 
 		 532 aa  210  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  30.05 
 
 		 531 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  29.89 
 
 		 885 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  32.88 
 
 		 594 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.35 
 
 		 911 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  32.88 
 
 		 594 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  33.99 
 
 		 512 aa  207  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  32.89 
 
 		 533 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  33.48 
 
 		 605 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  32.13 
 
 		 621 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 530 aa  206  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  32.75 
 
 		 503 aa  205  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  33.12 
 
 		 595 aa  205  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  31.44 
 
 		 530 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  31.64 
 
 		 556 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  29.95 
 
 		 535 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  31.11 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.59 
 
 		 740 aa  205  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  33.03 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2396  protein-export membrane protein SecD  32.35 
 
 		 637 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  31.78 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  31.33 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.53 
 
 		 848 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  30.61 
 
 		 532 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.33 
 
 		 849 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  31.44 
 
 		 554 aa  199  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  30.46 
 
 		 449 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  41.48 
 
 		 415 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  31.07 
 
 		 1029 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  33.01 
 
 		 554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.96 
 
 		 856 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  32.31 
 
 		 613 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  31.82 
 
 		 554 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  31.82 
 
 		 554 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  32.03 
 
 		 620 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.23 
 
 		 853 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  39.24 
 
 		 989 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  29.07 
 
 		 534 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  31.43 
 
 		 613 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  31.14 
 
 		 616 aa  195  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  31.36 
 
 		 613 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  30.97 
 
 		 625 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  41.91 
 
 		 735 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  31.68 
 
 		 533 aa  193  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  39.25 
 
 		 441 aa  193  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  30.9 
 
 		 537 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  40.29 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>