More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0758 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0758  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
242 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08111  ABC transporter, ATP-binding component  95.04 
 
 
242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08101  ABC transporter, ATP-binding component  95.45 
 
 
242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08341  ABC transporter, ATP-binding component  90.83 
 
 
237 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.119889  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07861  ABC transporter, ATP-binding component  70.74 
 
 
230 aa  328  7e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0716769  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0154  ABC transporter ATP-binding protein  70.74 
 
 
230 aa  327  8e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10131  ABC transporter, ATP-binding component  69.55 
 
 
251 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0945741 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16611  ABC transporter, ATP-binding component  66.97 
 
 
229 aa  314  8e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1219  ATPase  67.86 
 
 
225 aa  313  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0615432  normal  0.958487 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1250  ATPase  66.96 
 
 
237 aa  298  4e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  60.27 
 
 
237 aa  266  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  54.63 
 
 
237 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  55.2 
 
 
225 aa  255  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  54.63 
 
 
237 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  54.19 
 
 
453 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  54.63 
 
 
242 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  54.42 
 
 
232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  54.84 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  52.7 
 
 
241 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  53.88 
 
 
231 aa  239  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  53.18 
 
 
237 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  50.88 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0599  ABC transporter-like  48.36 
 
 
246 aa  222  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  49.11 
 
 
227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  48.42 
 
 
231 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  47.27 
 
 
408 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  45.09 
 
 
252 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  47.62 
 
 
217 aa  192  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  47.06 
 
 
245 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  49.25 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  44.09 
 
 
233 aa  188  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 
259 aa  188  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  43.38 
 
 
232 aa  184  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  43.84 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  42.73 
 
 
228 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  45.54 
 
 
662 aa  176  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  42.99 
 
 
277 aa  175  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.81 
 
 
228 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  42.34 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0036  ABC transporter related  39.91 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00248641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  41.55 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 
239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  44.29 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  38.12 
 
 
233 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  41.47 
 
 
225 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  42.6 
 
 
222 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  40.52 
 
 
238 aa  170  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  41.07 
 
 
237 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.75 
 
 
239 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.44 
 
 
230 aa  168  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  39.37 
 
 
233 aa  168  6e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
227 aa  168  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  40.18 
 
 
246 aa  168  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  42.33 
 
 
239 aa  168  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  41.1 
 
 
242 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  41.82 
 
 
241 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  40 
 
 
249 aa  167  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  38.81 
 
 
233 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  41.94 
 
 
220 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  39.64 
 
 
229 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  41.89 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  40.18 
 
 
249 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  40.18 
 
 
233 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.35 
 
 
237 aa  165  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  40.91 
 
 
241 aa  165  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  44.39 
 
 
779 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 
227 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  41.07 
 
 
240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  39.91 
 
 
244 aa  164  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  37.55 
 
 
240 aa  165  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
246 aa  164  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
255 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 
230 aa  164  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
246 aa  164  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  38.89 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  38.29 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  41.36 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  44.12 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0180  ABC transporter related  41.26 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0585319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  42.53 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5942  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
227 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  41.55 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  39.73 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  41.1 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  40.99 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
242 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  41.78 
 
 
225 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  41.1 
 
 
236 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  41.18 
 
 
241 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  39.82 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  39.11 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  40.27 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  37.67 
 
 
565 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  37.93 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  39.11 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>