72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0757 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  95.38 
 
 
390 aa  754    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  91.28 
 
 
390 aa  726    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  100 
 
 
390 aa  782    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  95.13 
 
 
390 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  71.28 
 
 
390 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  71.32 
 
 
391 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  71.32 
 
 
391 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  69.61 
 
 
389 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  64.16 
 
 
389 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  63.82 
 
 
389 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  51.31 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  52.23 
 
 
385 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  50.79 
 
 
385 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  50 
 
 
384 aa  381  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  47.64 
 
 
384 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  47.78 
 
 
388 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  47.38 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  46.21 
 
 
385 aa  356  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  47.12 
 
 
383 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  47 
 
 
388 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  43.08 
 
 
392 aa  332  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  42.49 
 
 
390 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  41.62 
 
 
388 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  41.45 
 
 
395 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  43.19 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  40.15 
 
 
397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  42.42 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  38.68 
 
 
385 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  34.18 
 
 
402 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  32.03 
 
 
393 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  26.68 
 
 
402 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  29.85 
 
 
376 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  30.03 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  27.73 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 
406 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  29.92 
 
 
376 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.34 
 
 
375 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  28.23 
 
 
410 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  25.49 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  23.16 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  22.77 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  23.56 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  25 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  21.28 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  20.3 
 
 
381 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  23.48 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  23.48 
 
 
366 aa  60.1  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  21.13 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3338  hypothetical protein  20 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  22.19 
 
 
378 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  22.45 
 
 
378 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  21.48 
 
 
378 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  21.48 
 
 
378 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  22.19 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  22.19 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  22.19 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  22.19 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  22.19 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  24.3 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  20.85 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  22.03 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  20.36 
 
 
378 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  21.54 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  23.98 
 
 
378 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  18.43 
 
 
386 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  22.07 
 
 
372 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  20.83 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  20.83 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 
401 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>