More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0565 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  81.47 
 
 		 463 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  72.05 
 
 		 466 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06211  chromosomal replication initiation protein  94.4 
 
 		 464 aa  868    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.62128  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 464 aa  964    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  71.77 
 
 		 464 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  95.04 
 
 		 464 aa  895    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  70.74 
 
 		 454 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  71.62 
 
 		 463 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  67.39 
 
 		 462 aa  621  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0973  chromosomal replication initiation protein  68.97 
 
 		 450 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  54.45 
 
 		 460 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  54.35 
 
 		 482 aa  529  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  54.09 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  54.23 
 
 		 456 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  53.28 
 
 		 453 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  52.75 
 
 		 453 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  52.53 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  45.49 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  45.87 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  45.43 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.87 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  45.16 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  45.16 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  45.16 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  45.16 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.87 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  45.16 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  45.87 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  44.56 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  44.78 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.59 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.42 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.2 
 
 		 463 aa  392  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  42.7 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  42.35 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  42.35 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  42.7 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  43.36 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  40.93 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  42.28 
 
 		 481 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  43.2 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  43.61 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  42.28 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.47 
 
 		 449 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.41 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.96 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  43.2 
 
 		 470 aa  363  4e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  42.01 
 
 		 442 aa  362  6e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.43 
 
 		 439 aa  362  8e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  42.6 
 
 		 445 aa  362  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.98 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 478 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  40.4 
 
 		 443 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.61 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.79 
 
 		 447 aa  353  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 		 449 aa  353  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.35 
 
 		 591 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.35 
 
 		 587 aa  351  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.87 
 
 		 456 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  40.69 
 
 		 472 aa  350  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  41.83 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  41.02 
 
 		 452 aa  342  9e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  41.02 
 
 		 452 aa  342  9e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  42.17 
 
 		 443 aa  342  9e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.75 
 
 		 453 aa  339  5e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  39.74 
 
 		 458 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.26 
 
 		 461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  38.53 
 
 		 459 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.4 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  39.39 
 
 		 460 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  40.53 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  38.44 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.8 
 
 		 509 aa  332  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  48.16 
 
 		 597 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  40.39 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.41 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  45.74 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.29 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  48.76 
 
 		 492 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.71 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.89 
 
 		 566 aa  329  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.36 
 
 		 447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  38.67 
 
 		 468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  47.87 
 
 		 495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  47.87 
 
 		 495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  47.87 
 
 		 495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0001  chromosomal replication initiation protein  49.58 
 
 		 577 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  39.56 
 
 		 455 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  38.94 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.77 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  38.22 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.55 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  37.42 
 
 		 495 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.76 
 
 		 570 aa  322  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.86 
 
 		 527 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  38.86 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  37.39 
 
 		 467 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  38.06 
 
 		 467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  37.39 
 
 		 467 aa  319  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>