More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0506 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  100 
 
 		 334 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  87.09 
 
 		 333 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  86.49 
 
 		 333 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  76.58 
 
 		 338 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  51.25 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  49.38 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  50.62 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  48.77 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  47.96 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  47.56 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  45.51 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  40.5 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  40.5 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  41.19 
 
 		 331 aa  282  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  42.01 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  42.09 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  42.01 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 329 aa  279  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  40.44 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  41.69 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  39.88 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  39.81 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  41.38 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  40.18 
 
 		 331 aa  268  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  41.77 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  40.75 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  39.94 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  38.3 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  39.21 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  39.94 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  41.18 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  38.91 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  38.91 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  38.78 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  39.18 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  38.36 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  38.05 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  38.01 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  37.81 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  41.53 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  37.38 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  38.7 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  37 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  36.7 
 
 		 331 aa  238  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  38.92 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  37.42 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  38.78 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  36.22 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  34.88 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  36.22 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  35.03 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  35.44 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  33.44 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  33.44 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  32.49 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  33.65 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  33.65 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  32.82 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  32.82 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  31.99 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  29.25 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  29.82 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  27.04 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  26.74 
 
 		 297 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  26.28 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  24.44 
 
 		 303 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  27.5 
 
 		 273 aa  92.4  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  24.82 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  25.32 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  23.4 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  25.37 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.85 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.55 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.55 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  25.5 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  25 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  24.55 
 
 		 315 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  27.21 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  21.85 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  26.57 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.55 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  21.85 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  26.39 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  25.74 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.24 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  27.13 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  25.44 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3227  inosine kinase  29.04 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00215137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.24 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.31 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  24.63 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  21.85 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  23.42 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  28.15 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  28.41 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  22.14 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  22.22 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>