More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0425 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  100 
 
 
438 aa  884    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  74.83 
 
 
437 aa  685    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  97.03 
 
 
438 aa  862    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  96.8 
 
 
438 aa  857    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  47.09 
 
 
432 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  45.5 
 
 
445 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  44.08 
 
 
450 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  46.53 
 
 
448 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  44.11 
 
 
445 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  46.53 
 
 
438 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  40.15 
 
 
451 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.23 
 
 
449 aa  309  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  37.8 
 
 
443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  42.89 
 
 
443 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  36.78 
 
 
446 aa  296  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  39.42 
 
 
451 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  39.69 
 
 
452 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  40.15 
 
 
451 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  34.54 
 
 
455 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  34.62 
 
 
449 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  33.26 
 
 
446 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.99 
 
 
451 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.84 
 
 
452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  35.93 
 
 
449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  33.01 
 
 
448 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  34.77 
 
 
444 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  33.09 
 
 
448 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  33.85 
 
 
447 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  33.65 
 
 
453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  35.46 
 
 
452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  33.49 
 
 
462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  34.88 
 
 
456 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  32.68 
 
 
452 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  34.22 
 
 
452 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  32.69 
 
 
457 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  31.61 
 
 
448 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  31.61 
 
 
448 aa  227  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  33.11 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  33.11 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  33.11 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  33.11 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  32.44 
 
 
444 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  32.89 
 
 
444 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  32.89 
 
 
444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  38.33 
 
 
427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  32.67 
 
 
444 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  32.67 
 
 
444 aa  223  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  30.63 
 
 
444 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  35.18 
 
 
429 aa  222  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  31.11 
 
 
444 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.05 
 
 
464 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  35.59 
 
 
429 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  34.96 
 
 
440 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  35.59 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  35.59 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  35.34 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  31.02 
 
 
440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  35.59 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  35.59 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  35.59 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  35.34 
 
 
429 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  33.57 
 
 
449 aa  216  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  37.53 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  30.89 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  34.4 
 
 
427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  35.07 
 
 
431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  37.78 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.09 
 
 
427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  34.84 
 
 
429 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  36.16 
 
 
429 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  36.82 
 
 
428 aa  210  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  31.59 
 
 
442 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  34.91 
 
 
427 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  36.16 
 
 
429 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  33.71 
 
 
439 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  36.32 
 
 
428 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  30.41 
 
 
435 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  30.41 
 
 
435 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  35.91 
 
 
429 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  33.81 
 
 
434 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.66 
 
 
436 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  28.05 
 
 
468 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  34.59 
 
 
451 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  36.07 
 
 
428 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  35.56 
 
 
428 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.09 
 
 
442 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  36.07 
 
 
428 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  36.07 
 
 
428 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  35.96 
 
 
427 aa  206  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  34.16 
 
 
429 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  34.16 
 
 
429 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  33.33 
 
 
445 aa  204  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  34.83 
 
 
429 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.86 
 
 
436 aa  203  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  33.67 
 
 
429 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  35.32 
 
 
428 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  31.76 
 
 
448 aa  203  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  34.9 
 
 
429 aa  203  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  33.91 
 
 
435 aa  203  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  33.67 
 
 
429 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>