160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0336 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 256 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  74.31 
 
 		 253 aa  360  1e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  74.7 
 
 		 253 aa  348  7e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  58.5 
 
 		 253 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  31 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  24.14 
 
 		 314 aa  96.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  23.44 
 
 		 337 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  27.94 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  27.45 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  31.47 
 
 		 596 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  30.1 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.85 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  32.81 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 		 661 aa  62.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  26.67 
 
 		 428 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.58 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  33.63 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  28.57 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 518 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.25 
 
 		 568 aa  59.7  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  32.67 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 544 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  27.59 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  30.63 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.51 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25.69 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  30.1 
 
 		 553 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  29.63 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  36.8 
 
 		 650 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  33.04 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  33.04 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  33.04 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  33.04 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  33.04 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  33.04 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.39 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  33.04 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  33.04 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  29.46 
 
 		 503 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  27.27 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 570 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  28.68 
 
 		 1079 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  28.7 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  32.17 
 
 		 430 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  26.15 
 
 		 550 aa  55.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 		 547 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  29.7 
 
 		 426 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  23.93 
 
 		 445 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  33.64 
 
 		 517 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.41 
 
 		 528 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  32.17 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  30.63 
 
 		 561 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  28.44 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.25 
 
 		 527 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  33.64 
 
 		 733 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.08 
 
 		 532 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  27.54 
 
 		 1556 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  25 
 
 		 338 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  28.36 
 
 		 849 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  31.3 
 
 		 430 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.93 
 
 		 576 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  26.79 
 
 		 390 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  25.41 
 
 		 620 aa  52  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.57 
 
 		 543 aa  52  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  35.48 
 
 		 409 aa  52  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  26.85 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  30.39 
 
 		 515 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0893  Peptidoglycan-binding LysM  41.79 
 
 		 137 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.58 
 
 		 499 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 405 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  31.58 
 
 		 487 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  27.13 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  31.82 
 
 		 419 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.01 
 
 		 581 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  28.57 
 
 		 394 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  33.61 
 
 		 571 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  32.73 
 
 		 390 aa  50.4  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0657  Peptidoglycan-binding LysM  27.1 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.93 
 
 		 517 aa  49.7  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  30.39 
 
 		 515 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  32.98 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  32.98 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  27.52 
 
 		 524 aa  49.3  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  29.41 
 
 		 515 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  28.44 
 
 		 514 aa  49.3  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  24.79 
 
 		 556 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  23.53 
 
 		 552 aa  48.9  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  23.74 
 
 		 563 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  29.13 
 
 		 517 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  32.71 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  26.23 
 
 		 638 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  22.29 
 
 		 414 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  26.27 
 
 		 498 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  23.64 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.77 
 
 		 801 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  26.73 
 
 		 390 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.96 
 
 		 389 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  23.44 
 
 		 542 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  47.83 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>