More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0260 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  76.72 
 
 
427 aa  667  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
423 aa  875  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  77.34 
 
 
411 aa  659  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  95.98 
 
 
423 aa  844  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  71.32 
 
 
427 aa  635  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  78.73 
 
 
431 aa  696  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  76.2 
 
 
429 aa  680  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  96.22 
 
 
423 aa  848  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  74.08 
 
 
416 aa  663  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  90.54 
 
 
423 aa  806  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  77.34 
 
 
411 aa  657  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  75.49 
 
 
424 aa  676  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  71.32 
 
 
425 aa  629  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  69.6 
 
 
425 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  69.6 
 
 
425 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  73.28 
 
 
427 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  72.51 
 
 
427 aa  612  1e-174  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  71.29 
 
 
426 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 
412 aa  549  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  63.44 
 
 
412 aa  545  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  63.44 
 
 
412 aa  545  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 
412 aa  535  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  62.14 
 
 
412 aa  537  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
411 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.28494e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 
415 aa  531  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 
429 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 
410 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
415 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 
410 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  60.91 
 
 
432 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 
437 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  60.43 
 
 
431 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
417 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.0982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 
415 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 
432 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 
422 aa  527  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 
415 aa  521  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 
413 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 
413 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
417 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 
417 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 
415 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 
412 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
413 aa  516  1e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  3.58223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 
417 aa  518  1e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
413 aa  515  1e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 
438 aa  516  1e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 
414 aa  516  1e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  4.68931e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 
413 aa  514  1e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.38182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 
424 aa  518  1e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  57.89 
 
 
415 aa  515  1e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
413 aa  516  1e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.15106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 
438 aa  516  1e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
413 aa  516  1e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 
413 aa  516  1e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 
427 aa  514  1e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 
416 aa  517  1e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 
430 aa  515  1e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 
420 aa  516  1e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 
414 aa  515  1e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 
439 aa  518  1e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 
414 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
419 aa  514  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.84892e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 
438 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  2.80655e-05  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 
413 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
413 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.29833e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 
417 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 
412 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 
415 aa  508  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 
412 aa  510  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 
416 aa  508  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 
417 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 
430 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 
431 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 
413 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.94889e-09  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 
417 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 
432 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
418 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  58.15 
 
 
413 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 
422 aa  506  1e-142  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
417 aa  504  1e-142  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  56.03 
 
 
423 aa  504  1e-142  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  58.16 
 
 
427 aa  505  1e-142  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 
415 aa  504  1e-142  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 
412 aa  507  1e-142  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 
412 aa  508  1e-142  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  56.67 
 
 
424 aa  506  1e-142  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 
417 aa  507  1e-142  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 
420 aa  507  1e-142  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 
419 aa  506  1e-142  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 
434 aa  506  1e-142  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 
433 aa  506  1e-142  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 
417 aa  504  1e-142  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
417 aa  504  1e-142  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
417 aa  506  1e-142  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
417 aa  504  1e-142  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  2.86459e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 
417 aa  507  1e-142  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  58.16 
 
 
427 aa  506  1e-142  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 
440 aa  507  1e-142  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
415 aa  505  1e-142  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.67671e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>