More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0228 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.62 
 
 		 612 aa  907    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.98 
 
 		 637 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  84.22 
 
 		 602 aa  1059    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.18 
 
 		 616 aa  882    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  83.77 
 
 		 615 aa  1025    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  72.12 
 
 		 613 aa  886    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  53.57 
 
 		 633 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  58.87 
 
 		 628 aa  685    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.17 
 
 		 632 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.24 
 
 		 657 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  54.3 
 
 		 637 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  80.45 
 
 		 617 aa  998    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  80.42 
 
 		 616 aa  994    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  56.49 
 
 		 639 aa  635    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  100 
 
 		 617 aa  1248    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  53.83 
 
 		 637 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.76 
 
 		 602 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  74.76 
 
 		 613 aa  955    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  57.33 
 
 		 630 aa  673    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  97.89 
 
 		 617 aa  1226    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  54.31 
 
 		 637 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  63.24 
 
 		 651 aa  723    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  83.6 
 
 		 615 aa  1024    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  96.61 
 
 		 619 aa  1197    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.1 
 
 		 615 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  83.47 
 
 		 615 aa  999    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.66 
 
 		 628 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.1 
 
 		 613 aa  898    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.26 
 
 		 631 aa  650    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  73.7 
 
 		 613 aa  911    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  56.47 
 
 		 628 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.15 
 
 		 628 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.98 
 
 		 637 aa  647    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.81 
 
 		 620 aa  641    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  98.54 
 
 		 617 aa  1233    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  58.02 
 
 		 673 aa  664    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.39 
 
 		 628 aa  685    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.48 
 
 		 616 aa  883    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.66 
 
 		 628 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.48 
 
 		 616 aa  883    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.62 
 
 		 639 aa  629  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  53.65 
 
 		 640 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.65 
 
 		 640 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.62 
 
 		 643 aa  628  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.71 
 
 		 616 aa  625  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  55.33 
 
 		 638 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.07 
 
 		 630 aa  627  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  55.46 
 
 		 632 aa  623  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  51.36 
 
 		 627 aa  620  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.2 
 
 		 655 aa  618  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.47 
 
 		 637 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.02 
 
 		 630 aa  617  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  52.37 
 
 		 659 aa  616  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.88 
 
 		 652 aa  615  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  53.17 
 
 		 633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  51.4 
 
 		 649 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  53.01 
 
 		 633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  53.01 
 
 		 633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  53.01 
 
 		 633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.76 
 
 		 639 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.89 
 
 		 640 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  53.01 
 
 		 633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.98 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  53.01 
 
 		 633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.89 
 
 		 640 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.3 
 
 		 656 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.65 
 
 		 640 aa  614  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  53.86 
 
 		 693 aa  613  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.52 
 
 		 656 aa  614  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  53.01 
 
 		 633 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.92 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.32 
 
 		 614 aa  608  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 		 657 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  53.01 
 
 		 633 aa  611  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.03 
 
 		 650 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.07 
 
 		 657 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.2 
 
 		 655 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 		 657 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 		 657 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 		 652 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.4 
 
 		 657 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.4 
 
 		 657 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.89 
 
 		 657 aa  610  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  52.52 
 
 		 633 aa  608  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.23 
 
 		 657 aa  608  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.27 
 
 		 638 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  51.22 
 
 		 650 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.74 
 
 		 638 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 		 607 aa  607  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.36 
 
 		 633 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.89 
 
 		 651 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  52.55 
 
 		 665 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.07 
 
 		 637 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  53.1 
 
 		 645 aa  607  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.28 
 
 		 651 aa  607  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 		 676 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.67 
 
 		 599 aa  608  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.54 
 
 		 657 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  52.13 
 
 		 647 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.46 
 
 		 647 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>