More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0135 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_01501  DNA repair protein RadA  93.56 
 
 		 450 aa  850    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01521  DNA repair protein RadA  91.98 
 
 		 450 aa  837    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.268386  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 449 aa  901    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01611  DNA repair protein RadA  82.44 
 
 		 450 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.821199  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  53.39 
 
 		 459 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  53.17 
 
 		 459 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  52.85 
 
 		 461 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 465 aa  488  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2383  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26521  DNA repair protein RadA  51.18 
 
 		 464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  45.88 
 
 		 478 aa  435  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  45.8 
 
 		 514 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  45.8 
 
 		 514 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  44.64 
 
 		 518 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  45.71 
 
 		 520 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  44.58 
 
 		 517 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  45.28 
 
 		 507 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  47.37 
 
 		 454 aa  428  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  44.96 
 
 		 458 aa  418  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  44.52 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  44.74 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  43.89 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  45.21 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  44.96 
 
 		 458 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  46.93 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  48.35 
 
 		 454 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  43.53 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  43.58 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  43.58 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  44.84 
 
 		 449 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  43.67 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  42.92 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  43.5 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  43.5 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  41.08 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  43.87 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  46.6 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  45.06 
 
 		 460 aa  388  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  43.12 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  44.15 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  44.62 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  43.11 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  42.67 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  43.24 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  42.06 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  44.27 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  41.46 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  43.21 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  43.17 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  42.67 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  43.16 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  43.16 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  43.69 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  42.38 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  43.03 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3492  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0825  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  41.44 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1280  DNA repair protein RadA  42.6 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  45.25 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  45.25 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  40.45 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3621  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  43.25 
 
 		 457 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  41.28 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  43.88 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  42.73 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1188  DNA repair protein RadA  42.47 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  41.65 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  42.25 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  42.25 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  42.49 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  41.06 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  42.25 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0667  DNA repair protein RadA  43.43 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  42.25 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  40.44 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  42.49 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  41.27 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  42.49 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  42.25 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  42.49 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  40 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  40.39 
 
 		 462 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  42.25 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  42.49 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  42.25 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>