More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0080 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  75.35 
 
 		 428 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 429 aa  871    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  89.28 
 
 		 429 aa  794    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  87.88 
 
 		 429 aa  779    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  55.22 
 
 		 455 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.95 
 
 		 735 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.92 
 
 		 733 aa  471  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.51 
 
 		 721 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  54.18 
 
 		 734 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.79 
 
 		 734 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.7 
 
 		 739 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 		 441 aa  441  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.53 
 
 		 731 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.63 
 
 		 726 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  48 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  45.28 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  46.82 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  44.94 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.18 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  44.24 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  44.6 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  43.19 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  41.63 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  42.02 
 
 		 446 aa  362  5.0000000000000005e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  44.44 
 
 		 432 aa  362  6e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  43.88 
 
 		 459 aa  359  5e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  41.53 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  42.72 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  42.72 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  43.29 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 435 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  41.42 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  42.52 
 
 		 440 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  42.02 
 
 		 437 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  44.58 
 
 		 444 aa  351  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  40.38 
 
 		 463 aa  350  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  43.17 
 
 		 416 aa  349  5e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  43.24 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  46.24 
 
 		 428 aa  349  5e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  42.52 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  42.99 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  42.65 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  43.13 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  42.35 
 
 		 448 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  42.18 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 457 aa  346  5e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  42.52 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  42.44 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 451 aa  343  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  40.77 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  42.22 
 
 		 485 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  42.44 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  42.07 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  42.42 
 
 		 422 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  43.13 
 
 		 447 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  38.51 
 
 		 448 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  42.33 
 
 		 427 aa  332  6e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  40.77 
 
 		 445 aa  332  6e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  41.33 
 
 		 457 aa  332  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  42.22 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  40.5 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  41.26 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  42.96 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  39.24 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  43.8 
 
 		 420 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  40.14 
 
 		 446 aa  328  8e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  43.43 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  40.77 
 
 		 446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  41.37 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  42.26 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  38 
 
 		 519 aa  324  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  43.39 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  38.68 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  40.42 
 
 		 447 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  40.77 
 
 		 453 aa  323  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  39.54 
 
 		 494 aa  323  5e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  41.05 
 
 		 445 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  42.58 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  38.71 
 
 		 465 aa  319  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  38.6 
 
 		 461 aa  318  7.999999999999999e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  41.11 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  38.94 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  41.61 
 
 		 419 aa  316  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  40.09 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  39.24 
 
 		 500 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  39.41 
 
 		 459 aa  312  6.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  41.47 
 
 		 505 aa  312  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  39.29 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  41.19 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  40.24 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  41.45 
 
 		 425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  39.72 
 
 		 459 aa  308  8e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  39.25 
 
 		 436 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  39.25 
 
 		 436 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  39.25 
 
 		 436 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  39.25 
 
 		 436 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  39.25 
 
 		 436 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  39.25 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  37.07 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  39.25 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>