More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0073 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0073  ABC transporter, membrane component  100 
 
 		 405 aa  813    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00831  ABC transporter, membrane component  85.15 
 
 		 405 aa  662    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.208147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00821  ABC transporter, membrane component  85.68 
 
 		 405 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.714133  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00801  ABC transporter, membrane component  72.59 
 
 		 405 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1434  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly permease component  42.97 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.56656  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01351  ABC transporter, membrane component  42.18 
 
 		 412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.228758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00791  ABC transporter, membrane component  38.36 
 
 		 408 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.917338 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0406  ABC transporter, membrane component  36.02 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.449797  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2280  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  36.56 
 
 		 392 aa  229  5e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.69897  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03041  ABC transporter, membrane component  31.1 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  31.77 
 
 		 454 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  39.3 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  38.31 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  40 
 
 		 448 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  28.02 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  38.76 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  32.71 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  35.58 
 
 		 455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  35.58 
 
 		 455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  30 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  36.19 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  37.5 
 
 		 447 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  34.6 
 
 		 383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  30.18 
 
 		 441 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  34.43 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  27.44 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  26.25 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  26.11 
 
 		 439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  34.43 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  30.63 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  32.95 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  31.05 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  26.62 
 
 		 439 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  36.52 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  23.97 
 
 		 437 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  32.89 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  28.93 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  25.78 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  33.94 
 
 		 439 aa  120  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  27.88 
 
 		 430 aa  119  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  27.94 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  33.7 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  30.43 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  24.75 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  38.51 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  29.74 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  26.05 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  32.35 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  28.04 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  31.79 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  30.8 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2592  SufBD protein  28.63 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.956009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  30.8 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  27.91 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  33.51 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  28.96 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  35.4 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  44.92 
 
 		 448 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  30.57 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  44.92 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  27.55 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  28.45 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  26.89 
 
 		 437 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  34.07 
 
 		 425 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  25.27 
 
 		 437 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  28.28 
 
 		 421 aa  109  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  32.39 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  32.39 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  31.75 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  31.61 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  33.94 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  38.19 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  44.44 
 
 		 434 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  43.22 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  43.22 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  43.22 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  42.11 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  42.11 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  42.11 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  42.11 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  42.11 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  42.11 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  42.11 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  31.64 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  42.11 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.1 
 
 		 453 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  26.78 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  43.22 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  42.37 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  43.22 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  43.22 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  43.22 
 
 		 441 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  46 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  22.22 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  44.25 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  39.86 
 
 		 441 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  41.23 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  22.04 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  27.17 
 
 		 439 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  31.55 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>