196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0031 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  100 
 
 
133 aa  280  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  94.74 
 
 
133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  92.48 
 
 
133 aa  266  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  84.21 
 
 
133 aa  244  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  72.87 
 
 
135 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  74.19 
 
 
136 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  75.21 
 
 
133 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  70.77 
 
 
136 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  70.73 
 
 
136 aa  197  6e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  70.49 
 
 
131 aa  196  9e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  63.96 
 
 
113 aa  159  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  61.95 
 
 
113 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  60.18 
 
 
113 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  60.36 
 
 
113 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  48.61 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  41.05 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  38.38 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  51.92 
 
 
169 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  39.74 
 
 
200 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  48.15 
 
 
166 aa  59.3  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  45.45 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  48.15 
 
 
177 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  39.74 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  54.76 
 
 
220 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  47.46 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  44.29 
 
 
184 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  50 
 
 
177 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  43.06 
 
 
169 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  50 
 
 
177 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  53.49 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  49.06 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  42.03 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  44.07 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  46.3 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  44.07 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  44.07 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  39.74 
 
 
198 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  42.86 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  43.06 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  38.24 
 
 
236 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  42.65 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  42.86 
 
 
168 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  42.67 
 
 
165 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  39.74 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  47.46 
 
 
220 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  45.76 
 
 
196 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  39.51 
 
 
166 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  51.22 
 
 
221 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  46.15 
 
 
171 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  43.1 
 
 
222 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  53.66 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  48.15 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  41.1 
 
 
197 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  42.65 
 
 
174 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  38.75 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  58.14 
 
 
189 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  43.1 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  40.54 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  46.67 
 
 
171 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  48.84 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  39.47 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  54.55 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  42.37 
 
 
205 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  43.86 
 
 
185 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  45.9 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  43.1 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  49.06 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  50 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  50.88 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  43.55 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  38.57 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  45.28 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  43.4 
 
 
177 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  50 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  43.33 
 
 
168 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  48.94 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  48.84 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  36.25 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  47.17 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  43.55 
 
 
168 aa  48.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  47.17 
 
 
181 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  50 
 
 
213 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  39.06 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  42.59 
 
 
170 aa  47.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3949  HNH endonuclease  51.16 
 
 
198 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  50 
 
 
354 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  40.58 
 
 
197 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  36.47 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  50 
 
 
182 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  43.4 
 
 
189 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  50 
 
 
182 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  40.51 
 
 
187 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  42.86 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  42.03 
 
 
185 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  35.62 
 
 
186 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  34.67 
 
 
182 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  42.59 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  40.98 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  40.98 
 
 
128 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  36.11 
 
 
315 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>