32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0018 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  92.11 
 
 
76 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00171  hypothetical protein  92.11 
 
 
76 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00171  hypothetical protein  65.28 
 
 
77 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  50.91 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00181  hypothetical protein  43.48 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.910571  normal  0.0515701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  45.45 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  39.71 
 
 
81 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  43.94 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  47.17 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  42.42 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00171  hypothetical protein  43.66 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46492  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  38.03 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  34.85 
 
 
84 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  42.42 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1345  hypothetical protein  42.25 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  35.71 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  36.36 
 
 
796 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  34.78 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  38.24 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  43.28 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  40.82 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  40.82 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  43.33 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  45.65 
 
 
83 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  40.82 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  43.86 
 
 
74 aa  42.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  35.94 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  35.94 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  38.71 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  36.21 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  36.73 
 
 
88 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>