260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0007 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0007  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00061  hypothetical protein  84.13 
 
 
318 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00061  hypothetical protein  84.13 
 
 
318 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00061  hypothetical protein  73.08 
 
 
314 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.454167  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00061  hypothetical protein  55.31 
 
 
321 aa  352  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  hitchhiker  0.000525225 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  51.32 
 
 
321 aa  352  4e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0007  4Fe-4S cluster binding  50 
 
 
331 aa  352  5e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00061  hypothetical protein  50.65 
 
 
324 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1334  hypothetical protein  52.77 
 
 
312 aa  345  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00061  hypothetical protein  53.64 
 
 
312 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  41.61 
 
 
317 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  40.4 
 
 
312 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 
308 aa  257  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  39.14 
 
 
306 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  37.22 
 
 
324 aa  245  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  40.26 
 
 
311 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  40.26 
 
 
311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  38.29 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  38.73 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  33.97 
 
 
326 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  38.41 
 
 
308 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  38.69 
 
 
312 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  36.22 
 
 
315 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.87 
 
 
309 aa  203  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  36.75 
 
 
314 aa  202  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  36.45 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00643  putative 4Fe-4S binding protein  35 
 
 
380 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0217  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.88 
 
 
349 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  33.44 
 
 
369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3972  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.81 
 
 
397 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.79 
 
 
343 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  34.77 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3244  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.75 
 
 
386 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  33.33 
 
 
343 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4624  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.18 
 
 
384 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000999766  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0891  4Fe-4S cluster binding protein  33.44 
 
 
363 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0619732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4634  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.18 
 
 
384 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000341327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0486  iron-sulfur cluster binding protein  32.49 
 
 
379 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4753  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.18 
 
 
384 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4774  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.18 
 
 
384 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0366705  normal  0.043554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4717  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.18 
 
 
384 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000105537  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  33.22 
 
 
347 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0425  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.86 
 
 
379 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000030316  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  33.33 
 
 
345 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2290  hypothetical protein  33.96 
 
 
347 aa  185  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  33.23 
 
 
375 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0200  hypothetical protein  33.23 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  33.13 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3925  iron-sulfur cluster binding protein  31.23 
 
 
379 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00310532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04033  predicted Fe-S electron transport protein  32.5 
 
 
379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000233876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3827  iron-sulfur cluster binding protein  32.5 
 
 
379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3847  iron-sulfur cluster binding protein  32.5 
 
 
379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000133072  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03995  hypothetical protein  32.5 
 
 
379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000106432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4409  iron-sulfur cluster binding protein  32.5 
 
 
379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4637  iron-sulfur cluster binding protein  32.5 
 
 
379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000171021  normal  0.0426509 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4697  iron-sulfur cluster binding protein  32.5 
 
 
379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000309577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4723  iron-sulfur cluster binding protein  32.5 
 
 
379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  31.03 
 
 
373 aa  182  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0529  iron-sulfur cluster binding protein  31.86 
 
 
379 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.465139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3728  iron-sulfur cluster binding protein  31.23 
 
 
379 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  31.27 
 
 
362 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  31.45 
 
 
354 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5682  iron-sulfur cluster binding protein  32.5 
 
 
379 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000046188  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.63 
 
 
355 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.19 
 
 
379 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2868  4Fe-4S cluster binding  35.8 
 
 
350 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  31.17 
 
 
362 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.56 
 
 
354 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  33.89 
 
 
380 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  31.17 
 
 
354 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2784  hypothetical protein  32.37 
 
 
343 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  33.12 
 
 
372 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2804  hypothetical protein  31.73 
 
 
348 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  29.94 
 
 
354 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  30.25 
 
 
354 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.82 
 
 
357 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur cluster binding protein  31.41 
 
 
348 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00414  iron-sulfur cluster binding protein, putative  33.44 
 
 
355 aa  175  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  31.46 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1337  hypothetical protein  32.46 
 
 
393 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  29.63 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  31.95 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.66 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.83 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0319  iron-sulfur cluster-binding protein  33.43 
 
 
398 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251377  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2530  4Fe-4S cluster binding  30.25 
 
 
385 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  32.79 
 
 
331 aa  172  5e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  27.78 
 
 
355 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2979  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.89 
 
 
387 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.27 
 
 
362 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  28.94 
 
 
411 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  28.94 
 
 
411 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.87 
 
 
361 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.37 
 
 
398 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  30.96 
 
 
361 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2758  iron-sulfur cluster binding protein  31.66 
 
 
356 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.620502  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0440  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.91 
 
 
388 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0782  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.99 
 
 
400 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00189399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  34.36 
 
 
404 aa  169  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  30.41 
 
 
366 aa  169  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>