More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0005 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.02 
 
 		 828 aa  741    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707356 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  85.24 
 
 		 813 aa  1366    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  47.61 
 
 		 827 aa  741    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2854  DNA topoisomerase IV subunit A  46.14 
 
 		 835 aa  683    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0005  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  45.59 
 
 		 806 aa  709    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  45.7 
 
 		 822 aa  746    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.793608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2820  DNA gyrase subunit A  46.19 
 
 		 835 aa  659    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0257012  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 813 aa  1630    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1694  DNA topoisomerase IV subunit A  44.95 
 
 		 858 aa  655    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1901  DNA topoisomerase IV subunit A  43.84 
 
 		 873 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1390  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.41 
 
 		 843 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.113611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  84.75 
 
 		 813 aa  1377    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  72.08 
 
 		 813 aa  1172    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  47.78 
 
 		 827 aa  748    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  46.27 
 
 		 829 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1360  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.51 
 
 		 835 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  46.08 
 
 		 856 aa  626  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1367  DNA gyrase, A subunit  42.05 
 
 		 839 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  45.94 
 
 		 853 aa  615  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0929  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.34 
 
 		 848 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  44.54 
 
 		 872 aa  606  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0531  DNA gyrase subunit A  44.07 
 
 		 869 aa  601  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.897683  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  44.58 
 
 		 865 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0561  DNA gyrase subunit A  43.7 
 
 		 857 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0578  DNA gyrase subunit A  43.7 
 
 		 857 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  40.64 
 
 		 863 aa  595  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  44.09 
 
 		 864 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11271  DNA gyrase subunit A  44.7 
 
 		 881 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.865928 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11681  DNA gyrase subunit A  40.57 
 
 		 865 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  45.75 
 
 		 872 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  52.43 
 
 		 886 aa  581  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11531  DNA gyrase subunit A  39.58 
 
 		 863 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15231  DNA gyrase subunit A  45.89 
 
 		 872 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  44.57 
 
 		 885 aa  578  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  43.96 
 
 		 875 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  43.44 
 
 		 865 aa  572  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  42.61 
 
 		 807 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  41.18 
 
 		 807 aa  547  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  41.66 
 
 		 809 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  40.73 
 
 		 827 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  40.19 
 
 		 897 aa  525  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  41.4 
 
 		 949 aa  521  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  38.66 
 
 		 814 aa  522  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  38.64 
 
 		 808 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  40.11 
 
 		 816 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  52.44 
 
 		 839 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  36.9 
 
 		 802 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  52.44 
 
 		 839 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  47.18 
 
 		 818 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  47.44 
 
 		 820 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  48.51 
 
 		 811 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  50.21 
 
 		 836 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  40.43 
 
 		 828 aa  511  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  37.98 
 
 		 824 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  50 
 
 		 836 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  50.2 
 
 		 809 aa  511  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  45.98 
 
 		 818 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  40.38 
 
 		 899 aa  512  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  39.04 
 
 		 809 aa  511  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  38.62 
 
 		 796 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  38.48 
 
 		 821 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 		 823 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  41.72 
 
 		 806 aa  505  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 		 823 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 		 823 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 		 823 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  46.05 
 
 		 825 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 		 823 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 		 823 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  46.4 
 
 		 852 aa  503  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0272  DNA gyrase, A subunit  37.55 
 
 		 816 aa  504  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00337054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  38.81 
 
 		 809 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3049  DNA gyrase, A subunit  43.39 
 
 		 965 aa  500  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  39.02 
 
 		 823 aa  502  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  48.22 
 
 		 812 aa  502  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000800696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  48.68 
 
 		 901 aa  502  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33633  predicted protein  37.33 
 
 		 818 aa  499  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 		 823 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  37.53 
 
 		 864 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  47.94 
 
 		 834 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  38.89 
 
 		 823 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  46.49 
 
 		 913 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  39.02 
 
 		 823 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  45.23 
 
 		 927 aa  500  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  46.13 
 
 		 915 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  48.81 
 
 		 832 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  38.6 
 
 		 841 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  45.59 
 
 		 913 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1400  DNA gyrase subunit A  45.23 
 
 		 929 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  39.09 
 
 		 809 aa  497  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  38.55 
 
 		 809 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  48.68 
 
 		 828 aa  498  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  46.95 
 
 		 934 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  46.95 
 
 		 922 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1744  DNA gyrase subunit A  45.05 
 
 		 941 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494976  normal  0.4202 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  46.21 
 
 		 816 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1744  DNA gyrase subunit A  44.68 
 
 		 943 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2876  DNA gyrase subunit A  46.49 
 
 		 925 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.987294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2596  DNA gyrase subunit A  46.31 
 
 		 917 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785629 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  46.95 
 
 		 923 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>