More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1852 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  100 
 
 		 376 aa  774    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  94.95 
 
 		 376 aa  735    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  60.53 
 
 		 375 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  59.31 
 
 		 375 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  57.26 
 
 		 377 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  56.27 
 
 		 381 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  51.99 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  51.85 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  51.6 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  51.33 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  39.52 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  37 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  33.96 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  34.59 
 
 		 368 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  32.7 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  35.14 
 
 		 374 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  31.08 
 
 		 376 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  24.61 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.28 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  27.43 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.18 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  24.2 
 
 		 376 aa  97.1  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 		 379 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.35 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  22.48 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 393 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  23.72 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.23 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  24.28 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  25.58 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  25.25 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  25.07 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  22.94 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  24.72 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  25.55 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  24.78 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  24.78 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  25.55 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  25.55 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  25.55 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  25.55 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  25.55 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 		 423 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  25.24 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  22.59 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27 
 
 		 423 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  20.84 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  23.78 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  22.61 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  22.75 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  24.03 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  22.31 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.72 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  24.63 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.41 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  23.69 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  23.57 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  24.39 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  26.54 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  23.55 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  23.62 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>