228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1813 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1813  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 165 aa  323  9e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0232218  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05371  putative nucleotide-binding protein  99.39 
 
 		 165 aa  320  4e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.280334 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0652  putative nucleotide-binding protein  69.09 
 
 		 165 aa  238  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1708  putative nucleotide-binding protein  66.67 
 
 		 165 aa  231  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06941  putative nucleotide-binding protein  66.87 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04811  putative nucleotide-binding protein  66.06 
 
 		 165 aa  228  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  55.76 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  51.52 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  55.76 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  53.33 
 
 		 163 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  50.3 
 
 		 165 aa  184  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  54.55 
 
 		 163 aa  181  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  53.94 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05441  putative nucleotide-binding protein  52.73 
 
 		 165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.519943  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0481  putative nucleotide-binding protein  52.12 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05061  putative nucleotide-binding protein  50.91 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05361  putative nucleotide-binding protein  49.7 
 
 		 165 aa  173  7e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  49.7 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  47.85 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  42.42 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  43.98 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 		 162 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  41.21 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  38.18 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  44.91 
 
 		 165 aa  123  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  40.96 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  43.98 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  39.39 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  39.39 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  40 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  43.37 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  38.18 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  41.1 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0527  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3464  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  39.39 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  37.58 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  37.58 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  39.76 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  41.57 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  41.92 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  39.75 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  38.18 
 
 		 163 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  40.61 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  37.58 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3028  putative nucleotide-binding protein  39.88 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.208181  normal  0.91414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  39.39 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>