More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1808 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 162 aa  322  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  96.91 
 
 		 162 aa  293  7e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  69.14 
 
 		 158 aa  217  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  74.65 
 
 		 159 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  74.65 
 
 		 159 aa  215  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  71.9 
 
 		 156 aa  213  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  67.28 
 
 		 158 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  83.9 
 
 		 150 aa  208  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  82.05 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04761  ribosomal protein L19  72.22 
 
 		 163 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  70.83 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 120 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 120 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 120 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 120 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  70.59 
 
 		 137 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  66.95 
 
 		 120 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0268  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.118712  normal  0.0551314 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 114 aa  141  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 117 aa  133  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 117 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 115 aa  130  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  52.99 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  59.43 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1533  ribosomal protein L19  61.82 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  55.75 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  55.26 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 126 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 132 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 115 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  57.48 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1066  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 116 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000285851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0178  ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 114 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000437176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0296  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000130489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1162  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000263892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 128 aa  122  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 127 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1257  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 117 aa  121  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000965232  hitchhiker  0.0000525185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0203  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000333718  normal  0.100248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  53.78 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  52.29 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  55.96 
 
 		 113 aa  120  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 		 114 aa  120  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 115 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 115 aa  120  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>