195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1805 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  100 
 
 
414 aa  778  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  99.76 
 
 
414 aa  778  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  82.11 
 
 
421 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  81 
 
 
402 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  73.87 
 
 
399 aa  539  1e-152  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  73.86 
 
 
399 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  78 
 
 
414 aa  515  1e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  72.89 
 
 
401 aa  515  1e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  72.39 
 
 
401 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  73.44 
 
 
421 aa  453  1e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  39.49 
 
 
652 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  39.49 
 
 
652 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  40.31 
 
 
629 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  41.77 
 
 
640 aa  233  4e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  38.72 
 
 
641 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  40.05 
 
 
628 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  39.07 
 
 
639 aa  213  4e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  40.95 
 
 
593 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  36.39 
 
 
741 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 
610 aa  192  8e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  41.94 
 
 
660 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  38.01 
 
 
637 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  29.4 
 
 
612 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 
622 aa  176  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 
637 aa  175  1e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  33.42 
 
 
607 aa  174  3e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  32.04 
 
 
597 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  32.82 
 
 
599 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  35.36 
 
 
651 aa  169  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 
611 aa  169  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.03 
 
 
666 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  32.38 
 
 
569 aa  166  6e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  31.3 
 
 
598 aa  162  8e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 
673 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 
670 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  33.71 
 
 
670 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.82 
 
 
669 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  33.42 
 
 
611 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 
616 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.12153e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  33.42 
 
 
611 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  36.34 
 
 
719 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.45 
 
 
596 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.45 
 
 
596 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  35.38 
 
 
625 aa  156  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.30765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.45 
 
 
596 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  30.45 
 
 
596 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.45 
 
 
596 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.45 
 
 
596 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  5.477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  31.72 
 
 
601 aa  154  3e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
596 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  31.62 
 
 
619 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  31.99 
 
 
601 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 
601 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 
620 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 
608 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  35.12 
 
 
643 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 
602 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.4 
 
 
763 aa  149  1e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  31.51 
 
 
617 aa  149  1e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  33.97 
 
 
599 aa  149  1e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 
602 aa  148  2e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 
604 aa  148  2e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  31.47 
 
 
623 aa  146  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  34.96 
 
 
660 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.55921e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  30.97 
 
 
625 aa  146  7e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  34.96 
 
 
660 aa  146  7e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 
607 aa  146  8e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  35.09 
 
 
660 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.62767e-05  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  31.47 
 
 
606 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  31.56 
 
 
764 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  35.09 
 
 
660 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  33.15 
 
 
616 aa  141  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 
760 aa  140  4e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  36.8 
 
 
702 aa  140  5e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 
617 aa  134  4e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.7 
 
 
626 aa  130  4e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  28.31 
 
 
617 aa  127  4e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  29.22 
 
 
595 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 
852 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 
609 aa  121  2e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  34.37 
 
 
407 aa  119  8e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  28.78 
 
 
630 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  28.02 
 
 
640 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 
584 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  29.62 
 
 
574 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  29.43 
 
 
597 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  28.03 
 
 
628 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.16 
 
 
498 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.45 
 
 
597 aa  85.5  1e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 
487 aa  84  5e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 
608 aa  82.8  1e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  26.21 
 
 
496 aa  82.4  1e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26.75 
 
 
596 aa  82.8  1e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 
414 aa  82.4  1e-14  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  26.68 
 
 
597 aa  80.5  5e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  28.83 
 
 
610 aa  80.5  6e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  25.25 
 
 
597 aa  77.4  4e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  27.65 
 
 
598 aa  77.4  4e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0869  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
417 aa  77  6e-13  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  24.2 
 
 
478 aa  75.9  1e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>