280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1752 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  100 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  100 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  90.12 
 
 
81 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  90.12 
 
 
81 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  90.12 
 
 
81 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  90.12 
 
 
81 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  90.12 
 
 
81 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  88.89 
 
 
81 aa  148  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  88.89 
 
 
81 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  88.89 
 
 
81 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  81.48 
 
 
81 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  80.25 
 
 
81 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  78.21 
 
 
79 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  78.21 
 
 
79 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  80.26 
 
 
76 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  72.73 
 
 
79 aa  125  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  75 
 
 
76 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  76.92 
 
 
80 aa  123  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  68.42 
 
 
225 aa  115  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  64.94 
 
 
213 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  66.67 
 
 
74 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  65.28 
 
 
74 aa  92  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  64.79 
 
 
78 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  64.79 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  64.79 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  64.79 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  64.79 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  64.79 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  64.79 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  64.79 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  64.79 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  64.79 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  64.79 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  59.72 
 
 
73 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  65.28 
 
 
74 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  63.89 
 
 
74 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  65.28 
 
 
73 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  59.72 
 
 
73 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  54.88 
 
 
103 aa  87.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  54.79 
 
 
73 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  63.89 
 
 
73 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  53.52 
 
 
80 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.29 
 
 
72 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  53.52 
 
 
80 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  53.52 
 
 
80 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  65 
 
 
300 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  63.16 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  63.16 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  50 
 
 
75 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  54.29 
 
 
72 aa  79.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  52.11 
 
 
74 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.45 
 
 
309 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.68 
 
 
306 aa  77.4  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.92 
 
 
294 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.92 
 
 
294 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.88 
 
 
73 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  46.34 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.07 
 
 
74 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.78 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  60 
 
 
293 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  54.41 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.52 
 
 
73 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  55 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.75 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  49.25 
 
 
187 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.07 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.27 
 
 
79 aa  72  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  48.53 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21001  hypothetical protein  87.5 
 
 
42 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  61.76 
 
 
72 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.48 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  50.75 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  50.75 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  50.75 
 
 
186 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  50.75 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.47 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  49.25 
 
 
187 aa  70.1  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.03 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.25 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  38.03 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  53.12 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.59 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  43.84 
 
 
76 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.78 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.72 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.38 
 
 
81 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.59 
 
 
86 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  61.76 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1377  NifU domain-containing protein  60.29 
 
 
72 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000465416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  47.14 
 
 
72 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  46.15 
 
 
88 aa  67  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  44.44 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  43.84 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.78 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1875  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.66 
 
 
299 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12597  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  44.12 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  47.95 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>