More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1748 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  100 
 
 		 400 aa  818    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  98 
 
 		 400 aa  806    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  60.21 
 
 		 391 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  56.85 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  56.56 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  55.93 
 
 		 388 aa  455  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  50.13 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  50.52 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  50 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  50.78 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  38.4 
 
 		 415 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  37.47 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  37.82 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  37.22 
 
 		 395 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  37.22 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  35.29 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  27.07 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  25.13 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  29.72 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  24.87 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  25.13 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  28.71 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  29.6 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  21.36 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  28.67 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.6 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  21.88 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  22.84 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  29.18 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.12 
 
 		 608 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.65 
 
 		 662 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  25.58 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  28 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.79 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  25.44 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.17 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  25.18 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.16 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  25.6 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  22.91 
 
 		 896 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  28.73 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  24.68 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.3 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  23.77 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  25 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.35 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  26.37 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.47 
 
 		 657 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.07 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.34 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  24.84 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.08 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  26.09 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  24.68 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  25.26 
 
 		 363 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.01 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  23.87 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.01 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  25.59 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  30.04 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  24.61 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  24.2 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  22.75 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  25.59 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  31.16 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.19 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.89 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.7 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  23.84 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.83 
 
 		 679 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  25.24 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  23.46 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.86 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.97 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  23.7 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.41 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.7 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.9 
 
 		 572 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  24.13 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.37 
 
 		 605 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.48 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.2 
 
 		 650 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  27.3 
 
 		 880 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.17 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  24.27 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.83 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.93 
 
 		 610 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  25.56 
 
 		 661 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.3 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.82 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  25.59 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  26.2 
 
 		 666 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  24.4 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.56 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.65 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.67 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.2 
 
 		 666 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>