More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1729 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  98.59 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  57.82 
 
 		 225 aa  252  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  59.69 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  56.77 
 
 		 199 aa  232  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  54.63 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  55.84 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  53.17 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  52.68 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  52.38 
 
 		 190 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  43.26 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  39.82 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  41.01 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  39.81 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  40.55 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  39.37 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  41.94 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  38.6 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.35 
 
 		 230 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  38.68 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.2 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  37.95 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  40.2 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  40.2 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  39.9 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  37.13 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  39.7 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  37.62 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  35.58 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  35.55 
 
 		 223 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  36.87 
 
 		 213 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  39.6 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  35.75 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  42.56 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  37.56 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  37.76 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  37.56 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  37.91 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  37.26 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  34.62 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  38.92 
 
 		 237 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  36.14 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  35.9 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  38.24 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  36.84 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  33.95 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  37.81 
 
 		 246 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  36.95 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  39.02 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  34.3 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  36.95 
 
 		 229 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  35.47 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  40.7 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  37.38 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  34.62 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  36.32 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  38.54 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  34.98 
 
 		 232 aa  121  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  34.01 
 
 		 229 aa  121  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  38.05 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  38.05 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  38.27 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  38.05 
 
 		 257 aa  121  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  38.05 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.31 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  39.71 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  35.61 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  36.71 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  37.19 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  36.5 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  37.13 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  34.47 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  35.21 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  38.05 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  32.86 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  33.98 
 
 		 237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  38.73 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  40.3 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  33.92 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  36.68 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  33.82 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  36.68 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  34.63 
 
 		 228 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  35.47 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  34.98 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  35.86 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  32.42 
 
 		 244 aa  117  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  36.22 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  37.13 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  36.68 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  36.02 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  36.1 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  33.66 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  35.96 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  35.5 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  35.81 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  35.47 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>