123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1686 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  100 
 
 		 411 aa  822    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  97.32 
 
 		 411 aa  801    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  53.17 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  51.58 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  55.06 
 
 		 414 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  50.88 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  50.37 
 
 		 409 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  49.26 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  49.62 
 
 		 409 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  36.41 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  35.94 
 
 		 413 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  35.11 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  34.6 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  34.62 
 
 		 417 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  33.66 
 
 		 427 aa  239  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  36.88 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  35.18 
 
 		 416 aa  236  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  36.63 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  35.83 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  34.77 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  34.36 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  34.66 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  34.08 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  35.01 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  33.1 
 
 		 424 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  34.38 
 
 		 426 aa  226  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  35.44 
 
 		 422 aa  219  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  32.79 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  31.19 
 
 		 476 aa  207  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  30 
 
 		 500 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  27.25 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  27.83 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  26.86 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  26.18 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  27.12 
 
 		 492 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  26.08 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  28.44 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  26.23 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  24.08 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  22.4 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  20.81 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.24 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.24 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  22.17 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  21.66 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  23.96 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  20.67 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  23.08 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  23.04 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  23.66 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  22.36 
 
 		 548 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  21.8 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  24.58 
 
 		 499 aa  54.7  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  21.2 
 
 		 489 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.16 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  21.49 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.91 
 
 		 500 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.09 
 
 		 501 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  22.64 
 
 		 518 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  23.81 
 
 		 496 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  22.58 
 
 		 505 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  21.97 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  22.2 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  21.97 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.59 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  22.09 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  26.73 
 
 		 505 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  23.53 
 
 		 480 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  22.86 
 
 		 496 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  25.7 
 
 		 496 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  22.27 
 
 		 472 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  22.52 
 
 		 512 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  21.36 
 
 		 510 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  21.19 
 
 		 472 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  21.15 
 
 		 482 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  25.7 
 
 		 502 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  21.19 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  21.15 
 
 		 482 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  20.09 
 
 		 501 aa  49.7  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  21.19 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  21.43 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  21.19 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  21.19 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  21.97 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  21.15 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  20.36 
 
 		 494 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  20.36 
 
 		 494 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  22.25 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.9 
 
 		 509 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  24.05 
 
 		 505 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  24.44 
 
 		 512 aa  47  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3131  carbohydrate kinase FGGY  22.63 
 
 		 481 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  22.3 
 
 		 487 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  26.75 
 
 		 505 aa  47  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2764  carbohydrate kinase  23.95 
 
 		 537 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  22.13 
 
 		 508 aa  46.6  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1144  xylulose kinase  23.95 
 
 		 537 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.41 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.41 
 
 		 509 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  22.55 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>