More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1683 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 362 aa  726    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  69.38 
 
 		 681 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  68.01 
 
 		 685 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  64.62 
 
 		 816 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  67.07 
 
 		 865 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  60.6 
 
 		 909 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  65.02 
 
 		 637 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  60.58 
 
 		 612 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  60.69 
 
 		 603 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  52.82 
 
 		 750 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  56.48 
 
 		 739 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  58.15 
 
 		 583 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  60.39 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  42.81 
 
 		 714 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  36.92 
 
 		 725 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  42.07 
 
 		 714 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  44.14 
 
 		 435 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  53.06 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  41.1 
 
 		 878 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.41 
 
 		 810 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  52.83 
 
 		 235 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  38.05 
 
 		 622 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  41.11 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  56.57 
 
 		 514 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  43.35 
 
 		 4489 aa  202  8e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  38.46 
 
 		 764 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  54.74 
 
 		 437 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1676 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  37.77 
 
 		 795 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  40.35 
 
 		 594 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.3 
 
 		 632 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  49.75 
 
 		 467 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  39.13 
 
 		 837 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  41.6 
 
 		 505 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  36.66 
 
 		 1694 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 1094 aa  184  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  39.92 
 
 		 780 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 3560 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  41.4 
 
 		 936 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  45.31 
 
 		 529 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  40.88 
 
 		 594 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  40.37 
 
 		 646 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  47.25 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  39.91 
 
 		 649 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  39.91 
 
 		 649 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  38.26 
 
 		 3035 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  32.98 
 
 		 732 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  35.47 
 
 		 875 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  39.21 
 
 		 718 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  42.45 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  36.1 
 
 		 3145 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 1276 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.97 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  51.9 
 
 		 484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 573 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 824 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  37.45 
 
 		 1827 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  45.22 
 
 		 512 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  43.03 
 
 		 1007 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 828 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  35.55 
 
 		 828 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  33.07 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 620 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.46 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  34.04 
 
 		 733 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.46 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.13 
 
 		 620 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 1737 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 3172 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 615 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  38.84 
 
 		 542 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  34.77 
 
 		 847 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  35.74 
 
 		 754 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.17 
 
 		 626 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  36 
 
 		 887 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 614 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 833 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  35.27 
 
 		 732 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.47 
 
 		 626 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 833 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 955 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.82 
 
 		 626 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.82 
 
 		 614 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 614 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 3301 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.82 
 
 		 614 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 639 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 543 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  37.28 
 
 		 828 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 612 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 614 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 601 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 		 602 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  38.28 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 636 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.49 
 
 		 707 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  53.79 
 
 		 653 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  38.34 
 
 		 535 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 750 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  34.08 
 
 		 1154 aa  142  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>