More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1562 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 401 aa  806    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  80.05 
 
 		 401 aa  665    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  79.3 
 
 		 401 aa  655    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  98.75 
 
 		 401 aa  797    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  82 
 
 		 402 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  81.3 
 
 		 401 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  77.11 
 
 		 402 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  76.87 
 
 		 402 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  76.12 
 
 		 402 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  75.31 
 
 		 402 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  74.06 
 
 		 402 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  72.25 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  72.25 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  74.06 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  70.57 
 
 		 401 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  72.57 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  72.75 
 
 		 398 aa  576  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  71.43 
 
 		 406 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  62.41 
 
 		 435 aa  490  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  58.75 
 
 		 394 aa  474  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  58.25 
 
 		 394 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  58.6 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  56.58 
 
 		 400 aa  459  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  60.93 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  56.75 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  56.25 
 
 		 394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  56.75 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  56.75 
 
 		 394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  58.25 
 
 		 441 aa  451  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  56.5 
 
 		 394 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48983  predicted protein  58.78 
 
 		 448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  56.5 
 
 		 394 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  55.75 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  56.25 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  56.25 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  55 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  56.25 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  56.75 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  56.86 
 
 		 650 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  55.5 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  56.44 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  56 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  56 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  55 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  56.04 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  56.04 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  55 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  56.25 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  55.53 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  56.5 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  54.11 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  55.83 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  55.33 
 
 		 395 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.12 
 
 		 654 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.75 
 
 		 646 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  55.67 
 
 		 393 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  53 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  54 
 
 		 395 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  53.75 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  53 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  56.59 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  54.75 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  56.59 
 
 		 397 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  53 
 
 		 399 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  53.47 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  53.13 
 
 		 399 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  56.5 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  54.26 
 
 		 402 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.98 
 
 		 655 aa  418  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  52.38 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  53.62 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  56.15 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  56.07 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  56.39 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  55.5 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  53.47 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  53.07 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  52 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  53.25 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  52.3 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  53.23 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  52.59 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  54.68 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  51.76 
 
 		 396 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  51.64 
 
 		 396 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  51.94 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  51.24 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  53.25 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 		 403 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  51.04 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  52.72 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  53.22 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  47.73 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>