More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1456 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 
392 aa  777  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  98.47 
 
 
392 aa  768  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  58.24 
 
 
395 aa  417  1e-115  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  57.67 
 
 
380 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  59.23 
 
 
351 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  58.48 
 
 
377 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  54.25 
 
 
373 aa  355  9e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  56.38 
 
 
383 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  52.85 
 
 
373 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  54.97 
 
 
357 aa  345  5e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  47.47 
 
 
376 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  46.32 
 
 
376 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  47.11 
 
 
376 aa  289  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1583  trypsin-like serine protease  47.24 
 
 
376 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  45.35 
 
 
353 aa  286  5e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  46.11 
 
 
362 aa  285  1e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  45.4 
 
 
411 aa  283  3e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  47.38 
 
 
408 aa  283  3e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  47.38 
 
 
408 aa  283  3e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  41.84 
 
 
381 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  41.84 
 
 
381 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  46.15 
 
 
415 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  43.21 
 
 
396 aa  278  9e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  45.56 
 
 
366 aa  276  3e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  44.05 
 
 
406 aa  276  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  3.57237e-08  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  43.65 
 
 
370 aa  274  2e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.97 
 
 
404 aa  273  5e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  45.4 
 
 
424 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  44.14 
 
 
411 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.65 
 
 
410 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  41.03 
 
 
391 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  43.29 
 
 
402 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  43.29 
 
 
402 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  46.44 
 
 
401 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  40.7 
 
 
383 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  40.11 
 
 
397 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  43.14 
 
 
394 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  45.05 
 
 
385 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  43.04 
 
 
372 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.34 
 
 
405 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  41.86 
 
 
402 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.33 
 
 
428 aa  258  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.62 
 
 
401 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  2.41562e-06  unclonable  1.45022e-07 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.63 
 
 
415 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  43.69 
 
 
420 aa  246  5e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.23 
 
 
387 aa  245  1e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.87 
 
 
405 aa  245  1e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  40.61 
 
 
375 aa  240  3e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.45 
 
 
416 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  42.31 
 
 
418 aa  233  4e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  37.23 
 
 
397 aa  233  4e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  44.41 
 
 
392 aa  226  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3211  predicted protein  38.86 
 
 
331 aa  223  5e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  41.37 
 
 
453 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  45.11 
 
 
382 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  42.47 
 
 
478 aa  216  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.25 
 
 
375 aa  215  1e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.94 
 
 
457 aa  214  2e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08291  trypsin-like serine protease  43.36 
 
 
384 aa  214  3e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  40.62 
 
 
379 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  4.2799e-08 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.19 
 
 
464 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.6609e-07  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  36.71 
 
 
452 aa  210  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4151  predicted protein  42.52 
 
 
299 aa  210  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.690672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.94 
 
 
458 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  38.51 
 
 
474 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  39.61 
 
 
500 aa  209  7e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.05 
 
 
381 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  35.89 
 
 
502 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  35.89 
 
 
485 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  39.8 
 
 
382 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  35.89 
 
 
502 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  35.89 
 
 
502 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  35.89 
 
 
461 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  35.89 
 
 
502 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  35.89 
 
 
502 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  44.71 
 
 
476 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  38.99 
 
 
477 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  36.39 
 
 
504 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  44.91 
 
 
464 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  36.5 
 
 
502 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  38.28 
 
 
400 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  35.89 
 
 
485 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  45.1 
 
 
476 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.75 
 
 
412 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  37.62 
 
 
459 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.12 
 
 
386 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.82436e-09  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  35.89 
 
 
490 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  39.41 
 
 
476 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.81376e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  39.05 
 
 
388 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.48342e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  42.91 
 
 
466 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.36052e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  44.91 
 
 
468 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  34.61 
 
 
502 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  36.13 
 
 
459 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  39.1 
 
 
505 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  43.86 
 
 
389 aa  202  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  38.48 
 
 
485 aa  202  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  39.94 
 
 
474 aa  202  1e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  39.94 
 
 
474 aa  202  1e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.07 
 
 
401 aa  201  1e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  40.07 
 
 
401 aa  201  1e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>