More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1455 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
572 aa  1155    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  63.59 
 
 
564 aa  715    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  63.99 
 
 
583 aa  731    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  65.97 
 
 
574 aa  764    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  98.95 
 
 
572 aa  1145    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  57.28 
 
 
536 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  61.1 
 
 
569 aa  687    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  57.94 
 
 
541 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  61.25 
 
 
564 aa  671    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  64.49 
 
 
581 aa  718    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  66.31 
 
 
575 aa  793    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  57.76 
 
 
541 aa  645    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  62.59 
 
 
575 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  57.81 
 
 
540 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  63.18 
 
 
567 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  65.67 
 
 
574 aa  800    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  48.53 
 
 
879 aa  511  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  41.87 
 
 
649 aa  466  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  43.1 
 
 
767 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  40.75 
 
 
668 aa  429  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  39.49 
 
 
649 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  40.93 
 
 
690 aa  423  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  40.77 
 
 
638 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 
645 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  40.86 
 
 
649 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  40.44 
 
 
672 aa  410  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  40.22 
 
 
632 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 
663 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  40.58 
 
 
709 aa  403  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  39.55 
 
 
641 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  40.11 
 
 
645 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  37.78 
 
 
540 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  38.45 
 
 
540 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  39.4 
 
 
663 aa  402  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  38.87 
 
 
659 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  38.26 
 
 
540 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  38.26 
 
 
540 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  39.07 
 
 
685 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  37.89 
 
 
560 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  37.78 
 
 
639 aa  394  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  37.41 
 
 
646 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  39.48 
 
 
630 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.45 
 
 
541 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
659 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
658 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  40.51 
 
 
644 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  38.1 
 
 
545 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  37.89 
 
 
540 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  40.31 
 
 
642 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  40.31 
 
 
642 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  38.45 
 
 
540 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  38.95 
 
 
544 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  38.45 
 
 
540 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  37.13 
 
 
548 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  37.13 
 
 
548 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  37.71 
 
 
540 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  39.12 
 
 
662 aa  389  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 
658 aa  389  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 
658 aa  389  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  38.01 
 
 
549 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 
640 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  36.95 
 
 
548 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 
644 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
658 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  38.5 
 
 
542 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.59 
 
 
645 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  40.63 
 
 
644 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 
546 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  39.78 
 
 
643 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  39.11 
 
 
658 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 
545 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  40.22 
 
 
644 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  38.7 
 
 
619 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  38.63 
 
 
540 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  39.71 
 
 
637 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  37.87 
 
 
544 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  37.78 
 
 
540 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  37.89 
 
 
540 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  37.52 
 
 
540 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  36.89 
 
 
634 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 
643 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  40.11 
 
 
643 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  39.71 
 
 
667 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  39.02 
 
 
650 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  36.85 
 
 
666 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  36.97 
 
 
540 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  37.82 
 
 
648 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  36.97 
 
 
543 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  37.52 
 
 
540 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  38.08 
 
 
540 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
656 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  38.49 
 
 
643 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  37.66 
 
 
543 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  37.71 
 
 
540 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  37.34 
 
 
539 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  40.59 
 
 
640 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  36.04 
 
 
565 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  37.59 
 
 
648 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  38.15 
 
 
535 aa  373  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  41.82 
 
 
630 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>