More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1434 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1434  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly permease component  100 
 
 		 412 aa  832    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.56656  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01351  ABC transporter, membrane component  97.82 
 
 		 412 aa  822    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.228758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0406  ABC transporter, membrane component  43.77 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.449797  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00791  ABC transporter, membrane component  43.28 
 
 		 408 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.917338 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2280  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  44.05 
 
 		 392 aa  323  5e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.69897  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03041  ABC transporter, membrane component  38.52 
 
 		 416 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00801  ABC transporter, membrane component  42.02 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0073  ABC transporter, membrane component  42.97 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00821  ABC transporter, membrane component  40.83 
 
 		 405 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.714133  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00831  ABC transporter, membrane component  41.76 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.208147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  31.16 
 
 		 454 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  31.77 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  32.3 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  29.34 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  30.07 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  29.86 
 
 		 448 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  31.13 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  30.17 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  29.29 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  29.29 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  30.55 
 
 		 426 aa  155  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  30.34 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  28.29 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  27.12 
 
 		 428 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  32.35 
 
 		 441 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  26.09 
 
 		 419 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  30.07 
 
 		 428 aa  135  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  26.08 
 
 		 399 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  27.27 
 
 		 438 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  27.68 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  25.74 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  32.33 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  28.5 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  33.88 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  27.93 
 
 		 475 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  28.24 
 
 		 426 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  29.27 
 
 		 439 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  26 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  27.55 
 
 		 467 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  33.48 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  24.94 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  25.3 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  26.93 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  33.05 
 
 		 454 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  33.05 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  27.34 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  33.05 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  27.96 
 
 		 459 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  26.93 
 
 		 433 aa  119  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  26.67 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  32.38 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  33.71 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  41.45 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.56 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  25.6 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  26.06 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  25.66 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  24.63 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  25.56 
 
 		 440 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  26.79 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  26.61 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.79 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  37.65 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  36.31 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.53 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  24.18 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  37.5 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  25.52 
 
 		 445 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.28 
 
 		 423 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.28 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  34.27 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  31.56 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.93 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  28.72 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.53 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  38.89 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.26 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.26 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.26 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  26.26 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  26.26 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  32.14 
 
 		 430 aa  107  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.88 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  38.97 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  32.96 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.63 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  28.04 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  31.46 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.27 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  30.95 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  39.13 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.7 
 
 		 441 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  24.63 
 
 		 434 aa  103  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  41.01 
 
 		 441 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  36.64 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  24.56 
 
 		 444 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.7 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.17 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  28.05 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>