More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1428 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  56.16 
 
 
660 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
662 aa  1334    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  56.8 
 
 
667 aa  805    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  99.7 
 
 
662 aa  1332    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  56.69 
 
 
660 aa  771    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  52.33 
 
 
668 aa  684    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  66.92 
 
 
658 aa  910    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  57.1 
 
 
660 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  56.88 
 
 
660 aa  775    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  74.47 
 
 
662 aa  1023    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  43.15 
 
 
665 aa  520  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  42.02 
 
 
663 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  42.02 
 
 
663 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  36.55 
 
 
667 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  41.02 
 
 
567 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  38.76 
 
 
534 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  40.35 
 
 
570 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  38.85 
 
 
603 aa  364  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  37.36 
 
 
576 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  35.38 
 
 
589 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  33.52 
 
 
611 aa  346  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  37.29 
 
 
575 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  36.42 
 
 
576 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  33.84 
 
 
669 aa  333  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  36.08 
 
 
563 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  35.75 
 
 
608 aa  320  3.9999999999999996e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.17 
 
 
587 aa  312  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  34.17 
 
 
587 aa  312  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  34.44 
 
 
575 aa  300  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  31.68 
 
 
588 aa  296  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  31.81 
 
 
586 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  31.91 
 
 
597 aa  288  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  31.67 
 
 
630 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  31.73 
 
 
606 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  32.32 
 
 
590 aa  283  6.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  35.38 
 
 
595 aa  283  6.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  32.54 
 
 
614 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  32.14 
 
 
578 aa  283  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  31.49 
 
 
583 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  31.46 
 
 
577 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  33.58 
 
 
606 aa  281  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  32.1 
 
 
614 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.31 
 
 
639 aa  280  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  32.1 
 
 
614 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  35.5 
 
 
602 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  30.4 
 
 
621 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  34.89 
 
 
626 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  30.65 
 
 
596 aa  276  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  30.25 
 
 
579 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  32.01 
 
 
589 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  32.45 
 
 
712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  32.68 
 
 
605 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  33.77 
 
 
615 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  31.83 
 
 
589 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.59 
 
 
589 aa  273  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  32.45 
 
 
704 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  31.41 
 
 
589 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.06 
 
 
598 aa  272  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  31.41 
 
 
589 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  30.95 
 
 
614 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  31.41 
 
 
589 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  31.53 
 
 
596 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  30.8 
 
 
713 aa  263  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  31.99 
 
 
636 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  31.51 
 
 
704 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1675  ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
571 aa  260  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0722052  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  29.98 
 
 
610 aa  259  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  33.45 
 
 
572 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  31.83 
 
 
613 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  30.69 
 
 
589 aa  258  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  32.03 
 
 
712 aa  258  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  30.99 
 
 
708 aa  258  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  29.44 
 
 
593 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  31.41 
 
 
577 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.14 
 
 
588 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
588 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
588 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
588 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  30.25 
 
 
588 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.96 
 
 
588 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.96 
 
 
588 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.96 
 
 
584 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.22 
 
 
592 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  29.89 
 
 
583 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  30.31 
 
 
634 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  30.31 
 
 
636 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  30.31 
 
 
636 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  33.33 
 
 
637 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  28.67 
 
 
701 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  28.55 
 
 
674 aa  244  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  29.65 
 
 
599 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  28.88 
 
 
588 aa  242  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  28.05 
 
 
591 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  28.11 
 
 
642 aa  239  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  31.24 
 
 
632 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  31.73 
 
 
635 aa  238  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  30.54 
 
 
626 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  29.57 
 
 
633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  28.81 
 
 
651 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  28.09 
 
 
595 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>