More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1233 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  85.37 
 
 		 750 aa  1174    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 909 aa  1853    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  73.71 
 
 		 816 aa  1128    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  50.08 
 
 		 739 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  41.76 
 
 		 4489 aa  591  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 1094 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  40.03 
 
 		 3560 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  38.9 
 
 		 3035 aa  548  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  64.23 
 
 		 685 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  62.47 
 
 		 681 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 761 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 1085 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  39.21 
 
 		 654 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  58.7 
 
 		 637 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  60.6 
 
 		 362 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  57.36 
 
 		 865 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 700 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 732 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  53.18 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 616 aa  379  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 618 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 667 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 		 632 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 808 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 828 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 828 aa  360  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 740 aa  355  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 833 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  54.99 
 
 		 612 aa  347  7e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 789 aa  346  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 833 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  53.64 
 
 		 603 aa  341  5e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 611 aa  340  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 828 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 706 aa  335  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 647 aa  327  7e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 754 aa  325  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 824 aa  324  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  46.33 
 
 		 878 aa  322  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  61.57 
 
 		 583 aa  319  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 660 aa  318  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 732 aa  317  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 1106 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 750 aa  315  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 1106 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.81 
 
 		 810 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  31.99 
 
 		 560 aa  302  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  31.73 
 
 		 680 aa  301  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  41.9 
 
 		 714 aa  298  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  28.59 
 
 		 754 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 569 aa  295  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 718 aa  291  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.4 
 
 		 1154 aa  281  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  40.78 
 
 		 714 aa  279  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.77 
 
 		 708 aa  277  6e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.31 
 
 		 585 aa  277  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 708 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  39.38 
 
 		 725 aa  275  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 574 aa  272  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  39.45 
 
 		 1676 aa  267  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.61 
 
 		 667 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1714 aa  258  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  30.73 
 
 		 632 aa  257  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  32.91 
 
 		 492 aa  256  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  33.41 
 
 		 459 aa  256  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 968 aa  254  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 626 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 789 aa  251  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.15 
 
 		 589 aa  251  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.38 
 
 		 632 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  41.67 
 
 		 764 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 595 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.55 
 
 		 837 aa  245  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  26.98 
 
 		 568 aa  244  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  39.3 
 
 		 462 aa  243  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.48 
 
 		 739 aa  243  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.82 
 
 		 1694 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 619 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  35.49 
 
 		 637 aa  243  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 598 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 627 aa  241  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  27.98 
 
 		 590 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 1276 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.26 
 
 		 589 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.52 
 
 		 742 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  35.03 
 
 		 657 aa  238  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 590 aa  237  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  34.17 
 
 		 657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.87 
 
 		 733 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 647 aa  235  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  25.41 
 
 		 937 aa  235  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.92 
 
 		 570 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  32.79 
 
 		 452 aa  235  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  34.45 
 
 		 630 aa  233  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 822 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  35.18 
 
 		 566 aa  232  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 672 aa  231  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  33.79 
 
 		 795 aa  231  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 295 aa  231  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>