31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1223 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1223  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102952  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20991  hypothetical protein  37.92 
 
 
248 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.449797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.48 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0216  hypothetical protein  34.47 
 
 
267 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1353  hypothetical protein  31.16 
 
 
251 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2528  hypothetical protein  30.6 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.333422  normal  0.549584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00871  hypothetical protein  33.04 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0546  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase-like protein  30.88 
 
 
249 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.88 
 
 
249 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1906  hypothetical protein  37.09 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.659216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3577  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.36 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1838  hypothetical protein  30.41 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0024  hypothetical protein  32.86 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0116  hypothetical protein  27.82 
 
 
246 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1844  hypothetical protein  29.6 
 
 
237 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1660  hypothetical protein  37.98 
 
 
237 aa  91.7  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000295507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0634  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.88 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137555  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01301  hypothetical protein  23.14 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3559  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.19 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14301  hypothetical protein  35.8 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3276  hypothetical protein  35.96 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4224  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.23 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.851728  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1454  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.22 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0412  hypothetical protein  24.64 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  27.75 
 
 
332 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3511  hypothetical protein  23.57 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0223  hypothetical protein  24.09 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000261911  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3275  hypothetical protein  23.68 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2846  hypothetical protein  23.68 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0106  foldase protein PrsA  29.2 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4385  hypothetical protein  20.61 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.016831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>