96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1210 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1210  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
114 aa  222  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20851  integral membrane protein  86.84 
 
 
114 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01601  hypothetical protein  45.45 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0090  putative integral membrane protein  45.33 
 
 
132 aa  66.6  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17581  hypothetical protein  37.66 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.195056  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0136  putative integral membrane protein  36.04 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  28 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  31.9 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
122 aa  50.8  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18411  hypothetical protein  32.11 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0015  camphor resistance CrcB protein  33.66 
 
 
126 aa  50.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18231  hypothetical protein  38.46 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.967069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  35.23 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  31.25 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  34.44 
 
 
122 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  28.7 
 
 
116 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  32.8 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  26.36 
 
 
118 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.47 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  33.73 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  29.66 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  34.31 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  34.31 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  29.09 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  30.23 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  32.8 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  34.26 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  29.79 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  27.37 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  27.97 
 
 
124 aa  43.5  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 
129 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0339  Camphor resistance CrcB protein  32.05 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  35.35 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  30.48 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1284  integral membrane protein for chromosome condensation  34.23 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000191693  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  31.46 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  29.35 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  34.44 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  29.75 
 
 
126 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  34.23 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
118 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  29.75 
 
 
126 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  27.97 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  27.97 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  27.91 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  36.23 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  28.26 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  29.6 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  28.26 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  29.03 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  30.68 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  25 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  32.35 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  27.88 
 
 
270 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  32.95 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0953  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  28.71 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0931  camphor resistance CrcB protein  36 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.683731  hitchhiker  0.00174486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  29.91 
 
 
132 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  27.97 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18201  hypothetical protein  36.71 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.689877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  30.51 
 
 
124 aa  40.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  29.7 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  36.51 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5013  CrcB protein  24.78 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
127 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
127 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  28 
 
 
132 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
127 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
127 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  36.51 
 
 
127 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
127 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
127 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  31.52 
 
 
122 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
127 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>