More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1208 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  100 
 
 
469 aa  925    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  76.06 
 
 
486 aa  643    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  75.8 
 
 
468 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  77.98 
 
 
468 aa  711    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  84.01 
 
 
471 aa  739    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  80.65 
 
 
473 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  99.57 
 
 
469 aa  919    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  77.09 
 
 
468 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  78.41 
 
 
469 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  74.67 
 
 
486 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  64.04 
 
 
465 aa  543  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  59.64 
 
 
468 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  58.97 
 
 
463 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  59.37 
 
 
466 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  60.05 
 
 
462 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  60.05 
 
 
462 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  43.22 
 
 
450 aa  329  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  39.37 
 
 
452 aa  325  1e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  36.7 
 
 
444 aa  317  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  37.41 
 
 
443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  37.81 
 
 
449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  42.76 
 
 
449 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  36.22 
 
 
446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  38.78 
 
 
458 aa  306  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  36.63 
 
 
449 aa  304  3.0000000000000004e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  37.28 
 
 
460 aa  299  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  37.35 
 
 
446 aa  299  8e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  35.6 
 
 
456 aa  295  1e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  37.16 
 
 
454 aa  295  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  37.2 
 
 
460 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  39.05 
 
 
465 aa  286  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  36.49 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  37.53 
 
 
463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  38.79 
 
 
444 aa  283  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  36.75 
 
 
460 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  37.86 
 
 
460 aa  282  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  35.45 
 
 
460 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  39.38 
 
 
452 aa  282  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  35.65 
 
 
454 aa  277  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  38.48 
 
 
453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  35.53 
 
 
460 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  34.94 
 
 
447 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  35.12 
 
 
449 aa  272  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  34.58 
 
 
463 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3406  magnesium transporter  39.73 
 
 
447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200177  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  37.88 
 
 
451 aa  266  5.999999999999999e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  36.49 
 
 
449 aa  261  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  35.59 
 
 
460 aa  260  4e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  38.12 
 
 
445 aa  258  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3240  magnesium transporter  39.2 
 
 
451 aa  257  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0666949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  38.3 
 
 
447 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  35.11 
 
 
450 aa  256  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  44.41 
 
 
454 aa  256  8e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  31.18 
 
 
454 aa  256  8e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  35.49 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  35.84 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  37.28 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  37.22 
 
 
462 aa  254  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  32.13 
 
 
447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  36.32 
 
 
461 aa  252  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  37 
 
 
450 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3316  magnesium transporter  39.55 
 
 
473 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  35.06 
 
 
461 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  36.16 
 
 
452 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  35.06 
 
 
461 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  37.59 
 
 
454 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  36.57 
 
 
447 aa  249  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  31.18 
 
 
455 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  38.6 
 
 
452 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  35.39 
 
 
462 aa  247  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  35.65 
 
 
445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  42.59 
 
 
351 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  37.41 
 
 
454 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  34.14 
 
 
461 aa  242  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  33.63 
 
 
461 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  31.18 
 
 
458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  35.45 
 
 
482 aa  236  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  37.32 
 
 
461 aa  236  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl217  Mg/Co/Ni transporter  30.5 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  31.64 
 
 
458 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  40.76 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  32.33 
 
 
463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  35.06 
 
 
444 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  33.63 
 
 
453 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  33.26 
 
 
465 aa  232  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  33.26 
 
 
465 aa  232  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  33.1 
 
 
542 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  37.56 
 
 
454 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  32 
 
 
460 aa  230  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33110  Mg2+ transporter MgtE  36.04 
 
 
446 aa  230  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237395  normal  0.754036 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  30.47 
 
 
449 aa  226  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  31.17 
 
 
454 aa  225  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  35.32 
 
 
456 aa  223  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1068  magnesium transporter  32.28 
 
 
441 aa  222  9e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  35.32 
 
 
456 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  30.73 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  33.76 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  35.68 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  34.15 
 
 
458 aa  219  6e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  31.28 
 
 
442 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>