More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1196 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  100 
 
 
246 aa  487  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  99.59 
 
 
246 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  88.16 
 
 
269 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  86.07 
 
 
248 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  85.6 
 
 
248 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  85.6 
 
 
248 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  85.19 
 
 
248 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  84.1 
 
 
290 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  83.9 
 
 
253 aa  404  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  83.61 
 
 
253 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  68.75 
 
 
255 aa  330  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.9 
 
 
243 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  58.47 
 
 
242 aa  273  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  58.47 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  57.63 
 
 
243 aa  271  9e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.2 
 
 
243 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.4 
 
 
247 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.2 
 
 
243 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  57.69 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  57.63 
 
 
244 aa  264  8e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  57.69 
 
 
259 aa  262  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  57.26 
 
 
248 aa  260  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  54.43 
 
 
248 aa  258  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  54.43 
 
 
248 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  55.98 
 
 
248 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  55.98 
 
 
248 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  54.43 
 
 
248 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  54.66 
 
 
248 aa  255  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  54.47 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.38 
 
 
230 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 
232 aa  205  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.14 
 
 
227 aa  203  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
229 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 
228 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.03 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  48.28 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.6 
 
 
239 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.01 
 
 
224 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.62 
 
 
223 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 
233 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 
225 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  47.86 
 
 
224 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.35 
 
 
226 aa  190  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 
235 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  45.26 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  49.13 
 
 
230 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 
236 aa  188  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 
227 aa  187  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  42.67 
 
 
226 aa  187  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  46.72 
 
 
231 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  44.02 
 
 
234 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 
229 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 
234 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 
231 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 
235 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 
237 aa  186  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  43.1 
 
 
235 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  47.62 
 
 
248 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 
225 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 
321 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 
242 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  46.96 
 
 
230 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 
226 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 
225 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 
239 aa  185  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 
239 aa  185  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44.59 
 
 
235 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 
230 aa  185  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
229 aa  185  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  43.22 
 
 
234 aa  185  7e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 
235 aa  184  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 
245 aa  184  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  42.26 
 
 
227 aa  184  8e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 
227 aa  184  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 
230 aa  184  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  43.23 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  42.68 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  41.63 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  44.59 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  44.59 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44.59 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  44.59 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  44.59 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  44.59 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44.59 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  46.06 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  44.87 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 
237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  46.52 
 
 
237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  41.81 
 
 
228 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 
243 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.98 
 
 
239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 
230 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 
231 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 
230 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>