More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1195 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 512 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 		 509 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  63.6 
 
 		 573 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 513 aa  1048    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  64.87 
 
 		 561 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  75.75 
 
 		 502 aa  779    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  74.15 
 
 		 502 aa  766    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  62.92 
 
 		 512 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 504 aa  662    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  77.09 
 
 		 503 aa  812    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 573 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  62.97 
 
 		 573 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  99.22 
 
 		 513 aa  1038    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  75.35 
 
 		 508 aa  783    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  63.37 
 
 		 488 aa  660    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 		 512 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  58.5 
 
 		 485 aa  580  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50879  predicted protein  54.79 
 
 		 607 aa  554  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 494 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 494 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 497 aa  518  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 495 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 495 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 499 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 499 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 489 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 499 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 489 aa  502  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 490 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 501 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 501 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 509 aa  498  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  497  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 489 aa  492  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 647 aa  485  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.2 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  51.2 
 
 		 491 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 503 aa  481  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 499 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 502 aa  475  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 502 aa  478  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 501 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 502 aa  478  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 492 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 488 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 492 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 523 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 631 aa  472  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  49.9 
 
 		 498 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 1118 aa  468  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 489 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 498 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 502 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 489 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 508 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 494 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 508 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 504 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 496 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 508 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 508 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 524 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 508 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 508 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 511 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 508 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>