47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1167 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1167  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
258 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20421  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  99.61 
 
 
258 aa  537  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17131  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  57.98 
 
 
257 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0422  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  54.12 
 
 
271 aa  305  6e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.4392  normal  0.0295083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22441  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  51.75 
 
 
257 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1907  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  50.19 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4518  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  41.22 
 
 
247 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17841  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  37.76 
 
 
253 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.373493  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5729  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  39.83 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1684  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  36.1 
 
 
253 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5050  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  38.62 
 
 
256 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18011  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  37.34 
 
 
253 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0919498  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17791  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  34.44 
 
 
258 aa  164  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.600264  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45446  predicted protein  36.22 
 
 
342 aa  112  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.505627  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5728  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  29.67 
 
 
242 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4517  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  29.26 
 
 
246 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.991072  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5051  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  28.02 
 
 
244 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10830  predicted protein  29.28 
 
 
183 aa  85.5  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  30.73 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0423  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  27.85 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.544521  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33770  predicted protein  27.06 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17851  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  26.87 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.399426  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18021  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  27.36 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.242937  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1685  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  27.36 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.399665  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1168  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  29.9 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.561084  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  29.9 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17801  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  30.14 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1906  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  25.32 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.176317  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17141  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  24.88 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.695365  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0093  ferredoxin-dependent bilin reductase  25.24 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1748  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  25.62 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1724  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  25.62 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3585  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  23.11 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.561892  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4156  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  24.39 
 
 
245 aa  55.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1047  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  25.45 
 
 
245 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866548 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07831  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.72 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.299977  normal  0.406136 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0151  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.72 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4845  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  24 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0755  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  26.18 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.574413  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16581  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.46 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15568  predicted protein  22.9 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08371  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.38 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.336016  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08071  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.39 
 
 
241 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08081  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  23.39 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0987518  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1225  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  23.04 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.441578 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1216  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  24.48 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.261632  normal  0.953756 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1253  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  28.33 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>