207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1157 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  100 
 
 		 214 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  99.53 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  70.56 
 
 		 214 aa  324  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  63.55 
 
 		 214 aa  298  6e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  61.84 
 
 		 214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  62.56 
 
 		 212 aa  257  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  57.62 
 
 		 213 aa  255  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  57.14 
 
 		 211 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  57.62 
 
 		 211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  61.7 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  56.37 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  55.88 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  57.35 
 
 		 209 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  54.85 
 
 		 211 aa  241  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  54.37 
 
 		 207 aa  241  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  55.88 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  55.39 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  55.39 
 
 		 209 aa  231  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  47.09 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  50.54 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  46.84 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  46.89 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  46.32 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  45.79 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  44.17 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  46.46 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  45.79 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  42.31 
 
 		 204 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  45.7 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  42.51 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  43.68 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  45.26 
 
 		 204 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  46.63 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  44.68 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  44.68 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  43.94 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  44.5 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  46.77 
 
 		 205 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  43.92 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  45.41 
 
 		 203 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  44.68 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  45.08 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  46.56 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  48.4 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  45.5 
 
 		 204 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  42.79 
 
 		 208 aa  164  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  44.27 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  46.11 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  46.77 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  46.32 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  44.86 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  46.77 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  42.71 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  46.24 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  44.63 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  44.89 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  42.19 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  42.58 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  42.78 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  43.68 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  39.44 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  47.31 
 
 		 206 aa  148  8e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  41.08 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  40.1 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  35.29 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  33.53 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  29.41 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  33.12 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  29.14 
 
 		 582 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  32.09 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  32.09 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  31.68 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  30.98 
 
 		 409 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  31.16 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  29.82 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  32.28 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  31.75 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  31.18 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  32.3 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  30.05 
 
 		 396 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  29.59 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  33.55 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  30.34 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0601  DNA-directed DNA polymerase  31.55 
 
 		 587 aa  63.2  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5140  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.91 
 
 		 648 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.76274e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  31.68 
 
 		 392 aa  62  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  31.46 
 
 		 392 aa  62  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0869  ribonuclease D  32.53 
 
 		 391 aa  62  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  30.34 
 
 		 405 aa  61.6  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  28.96 
 
 		 583 aa  61.6  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  29.94 
 
 		 392 aa  61.6  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.12 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  29.82 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  31.93 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.25 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  28.22 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  29.19 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  29.19 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  27.85 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  29.01 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>