More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1129 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  97.71 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  82.11 
 
 		 218 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  82.57 
 
 		 218 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  80.28 
 
 		 218 aa  358  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  77.52 
 
 		 219 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 217 aa  331  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 217 aa  330  1e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 217 aa  327  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  72.38 
 
 		 217 aa  324  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  67.62 
 
 		 213 aa  301  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  63.51 
 
 		 212 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  61.9 
 
 		 211 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  60 
 
 		 211 aa  279  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  60.19 
 
 		 212 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  60.19 
 
 		 212 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  58.57 
 
 		 212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  57.33 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  54.41 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  55.17 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 209 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 209 aa  224  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 210 aa  222  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 209 aa  221  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 212 aa  214  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 206 aa  214  7e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 204 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 211 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 208 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  44.12 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  208  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 210 aa  208  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  47.57 
 
 		 222 aa  208  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 217 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 217 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 207 aa  207  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 207 aa  207  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  47.64 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  48.11 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36377  Plastid ribosomal protein L3, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  48.57 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  48.54 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  49.04 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  45.37 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  46.41 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 220 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  45.33 
 
 		 214 aa  201  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000449005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 		 211 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 216 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  48.04 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 208 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  46.6 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 216 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  45.79 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000128128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  47.78 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  47.62 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  45.37 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  48.84 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 		 212 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 211 aa  198  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  44.39 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  47.78 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  44.88 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 205 aa  198  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3804  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 223 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000896818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 223 aa  198  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 219 aa  197  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3776  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000325408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>