More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1129 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  97.71 
 
 
218 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  82.57 
 
 
218 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  82.11 
 
 
218 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  80.28 
 
 
218 aa  358  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  77.52 
 
 
219 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 
217 aa  331  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 
217 aa  330  1e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 
217 aa  327  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  72.38 
 
 
217 aa  324  8e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  67.62 
 
 
213 aa  301  5e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  63.51 
 
 
212 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  61.9 
 
 
211 aa  283  2e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  60 
 
 
211 aa  279  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  60.19 
 
 
212 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  60.19 
 
 
212 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  58.57 
 
 
212 aa  273  2e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  1.67398e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  57.33 
 
 
227 aa  266  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  54.41 
 
 
210 aa  237  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.81122e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 
211 aa  233  2e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.30884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 
210 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  55.17 
 
 
209 aa  227  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 
209 aa  225  5e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.31855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 
209 aa  224  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.24684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
209 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.95061e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 
209 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 
210 aa  222  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.29631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 
209 aa  221  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  51.94 
 
 
213 aa  217  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 
212 aa  214  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  49.01 
 
 
206 aa  214  7e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.66904e-09  hitchhiker  5.67921e-07 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 
209 aa  214  1e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  3.70606e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  50.96 
 
 
204 aa  214  1e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
210 aa  213  2e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.29954e-06 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  50.49 
 
 
216 aa  212  3e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 
219 aa  212  3e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
214 aa  212  3e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.7151e-11  hitchhiker  1.66028e-07 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  47.34 
 
 
209 aa  212  4e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.70125e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
210 aa  211  6e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.05997e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
210 aa  211  6e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.41135e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
210 aa  211  6e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.68091e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
210 aa  211  6e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.51418e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
210 aa  211  6e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.46604e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
210 aa  211  6e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.28056e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
210 aa  211  6e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.67077e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
210 aa  211  6e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.86131e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
208 aa  211  8e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
210 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.42867e-10  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
210 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.75669e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 
218 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 
211 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.94381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 
210 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 
208 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.2853e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  44.12 
 
 
211 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  47.57 
 
 
222 aa  208  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 
210 aa  208  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.19433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  50 
 
 
210 aa  208  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 
217 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  2.76942e-07  decreased coverage  1.34206e-07 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 
217 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  5.38385e-07  hitchhiker  8.07722e-05 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 
207 aa  207  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 
207 aa  207  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.63563e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  47.64 
 
 
212 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  2.41734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 
216 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  48.11 
 
 
218 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36377  Plastid ribosomal protein L3, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  48.57 
 
 
241 aa  206  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  48.54 
 
 
219 aa  205  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  49.04 
 
 
213 aa  205  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 
216 aa  203  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  3.85888e-10  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 
213 aa  202  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 
221 aa  202  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  45.37 
 
 
209 aa  201  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.45621e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  46.41 
 
 
217 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
220 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  45.33 
 
 
214 aa  201  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  4.49005e-07  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 
216 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 
211 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.51121e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 
219 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  1.11519e-07  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 
216 aa  201  1e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  46.6 
 
 
206 aa  200  1e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  4.02835e-07  hitchhiker  3.18342e-09 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  48.04 
 
 
226 aa  200  1e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 
208 aa  201  1e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 
217 aa  199  2e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  1.08395e-11  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  45.37 
 
 
209 aa  199  2e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  47.78 
 
 
209 aa  199  2e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.17498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  46.89 
 
 
216 aa  200  2e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  47.62 
 
 
218 aa  199  2e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  45.79 
 
 
216 aa  200  2e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  1.28128e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 
212 aa  199  2e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  2.54045e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  45.45 
 
 
215 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  48.84 
 
 
212 aa  198  4e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
212 aa  199  4e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.33446e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 
211 aa  198  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  3.99657e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  44.39 
 
 
214 aa  198  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  3.24929e-11  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  47.78 
 
 
219 aa  198  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  44.88 
 
 
209 aa  198  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.9924e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 
205 aa  198  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  6.60439e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 
223 aa  198  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3804  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 
223 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000896818  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 
219 aa  197  8e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3746  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 
219 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  2.1686e-12  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>