More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1103 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  79.05 
 
 		 170 aa  258  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  83.33 
 
 		 150 aa  258  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  78.67 
 
 		 150 aa  255  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  81.94 
 
 		 150 aa  254  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  76.55 
 
 		 143 aa  237  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  74.65 
 
 		 143 aa  235  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  73.94 
 
 		 143 aa  234  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  74.65 
 
 		 143 aa  233  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  68.97 
 
 		 151 aa  228  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  68.97 
 
 		 151 aa  227  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 151 aa  226  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 151 aa  226  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  68.28 
 
 		 149 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  67.59 
 
 		 151 aa  214  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  65.28 
 
 		 151 aa  206  9e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2985  50S ribosomal protein L13  63.45 
 
 		 151 aa  205  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  185  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  185  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 146 aa  184  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  58.5 
 
 		 154 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 146 aa  179  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 145 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  174  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  174  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  174  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  174  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  174  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  174  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  174  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  54.55 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  173  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 144 aa  173  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 147 aa  173  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 145 aa  173  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 144 aa  173  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 163 aa  172  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>